RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587215.1

PKN1-209, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 363 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-209	ENST00000587215	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	SLAMF9	Q96A28	289 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	CEP19	Q96LK0	163 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	TMEM82	A0PJX8	343 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215		J3QRE1	110 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	SERPINA3	P01011	423 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	ZNF728	P0DKX0	622 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	RAB13	P51153	203 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	RFK	Q969G6	155 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	C10orf35	Q96D05	121 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	SNX22	Q96L94	193 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	GNG8	Q9UK08	70 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	VGLL3	A8MV65	326 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	ODF3B	A8MYP8	253 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215		E9PQ18	207 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	CHST1	O43916	411 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	ENTPD6	O75354	484 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	NPBWR2	P48146	333 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	CDC42	P60953	191 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	TCF23	Q7RTU1	214 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	BORCS8	Q96FH0	119 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	ALPL	P05186	524 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	RBP2	P50120	134 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	EDDM3B	P56851	147 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	OR12D2	P58182	307 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	HERPUD1	Q15011	391 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	OR8H2	Q8N162	312 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	PP6455	Q8WZ26	134 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	FGGY	Q96C11	551 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	MALSU1	Q96EH3	234 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	RAB18	Q9NP72	206 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PKN1-209	ENST00000587215	CIB2	O75838	187 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	HAND1	O96004	215 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	IGHA1	P01876	353 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	RBP4	P02753	201 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	ARG1	P05089	322 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	ISG15	P05161	165 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	CSF1	P09603	554 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	ATF1	P18846	271 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	BCL3	P20749	454 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	DUSP1	P28562	367 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	ATP1B3	P54709	279 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	PLA1A	Q53H76	456 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	ZNF626	Q68DY1	528 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	FDX2	Q6P4F2	183 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	CFHR4	Q92496	578 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	RNFT2	Q96EX2	444 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	ZNF714	Q96N38	554 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	AASS	Q9UDR5	926 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215		H3BNX3	289 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	PSPN	O60542	156 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	CALCB	P10092	127 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	MTCP1	P56278	107 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	ZNF91	Q05481	1191 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	EDDM3A	Q14507	147 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PKN1-209	ENST00000587215	ZNF146	Q15072	292 aa		13.38	□□□□□ -0.27

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