RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524296.5

SFI1-228, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 5

Gene SFI1, Length 2,108 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-228	ENST00000524296	OR8U1	Q8NH10	309 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SFI1-228	ENST00000524296	UCN2	Q96RP3	112 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SFI1-228	ENST00000524296	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
SFI1-228	ENST00000524296	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SFI1-228	ENST00000524296	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SFI1-228	ENST00000524296	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SFI1-228	ENST00000524296	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SFI1-228	ENST00000524296	MED12	Q93074	2177 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SFI1-228	ENST00000524296	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SFI1-228	ENST00000524296	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SFI1-228	ENST00000524296	COLCA2	A8K830	154 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SFI1-228	ENST00000524296	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SFI1-228	ENST00000524296	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
SFI1-228	ENST00000524296	CCL4	P13236	92 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SFI1-228	ENST00000524296	CRYGS	P22914	178 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SFI1-228	ENST00000524296	ACKR3	P25106	362 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SFI1-228	ENST00000524296	ID4	P47928	161 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SFI1-228	ENST00000524296	CHAF1B	Q13112	559 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SFI1-228	ENST00000524296	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SFI1-228	ENST00000524296	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SFI1-228	ENST00000524296	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SFI1-228	ENST00000524296	TOMM40L	Q969M1	308 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SFI1-228	ENST00000524296	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SFI1-228	ENST00000524296	LIME1	Q9H400	295 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SFI1-228	ENST00000524296	WDR54	Q9H977	334 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SFI1-228	ENST00000524296	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SFI1-228	ENST00000524296	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SFI1-228	ENST00000524296	TSPAN15	O95858	294 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	CELA2A	P08217	269 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	SEC11B	P0C7V7	166 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	CHAT	P28329	748 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	TAF9	Q16594	264 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	LRTM2	Q8N967	370 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	ERGIC1	Q969X5	290 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	REEP6	Q96HR9	211 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	DKKL1	Q9UK85	242 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	STARD10	Q9Y365	291 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	SGCE	O43556	437 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	ANGPTL7	O43827	346 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	GPR137B	O60478	399 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	MEOX2	P50222	304 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	ASCL4	Q6XD76	172 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	TINAG	Q9UJW2	476 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296		H7C1Q1	480 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	ZIC3	O60481	467 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	OR5AC1	P0C628	307 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	CCL3	P10147	92 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	SNCA	P37840	140 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	KCNJ3	P48549	501 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	RBP2	P50120	134 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	RRAD	P55042	308 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	RAB5B	P61020	215 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	LPAL2	Q16609	132 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	GPR157	Q5UAW9	335 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	GNRHR2	Q96P88	292 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	LUZP4	Q9P127	313 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	SYNGR3	O43761	229 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	CER1	O95813	267 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	UMOD	P07911	640 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	DANCR	P0C864	163 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	OPRM1	P35372	400 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	RGS19	P49795	217 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	IL11RA	Q14626	422 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	SP6	Q3SY56	376 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	NTNG2	Q96CW9	530 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	BORCS8	Q96FH0	119 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	C18orf12	Q96KH6	178 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	GINS3	Q9BRX5	216 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	CST2	P09228	141 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	P2RY1	P47900	373 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	PPT1	P50897	306 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	UCP2	P55851	309 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	IL13RA2	Q14627	380 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	EXT1	Q16394	746 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	MIDN	Q504T8	468 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	ZFP82	Q8N141	532 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SFI1-228	ENST00000524296	PROK2	Q9HC23	129 aa		13.62	□□□□□ -0.23

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