RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM99Q8N816 258 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 BBS1Q8NFJ9 593 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5D18Q8NGL1 313 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 NMNAT3Q96T66 252 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ALG12Q9BV10 488 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 KLHL13Q9P2N7 655 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 B3GAT1Q9P2W7 334 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 OR52A1Q9UKL2 312 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 PRSS37A4D1T9 235 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 J3QRE1 110 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 TNFSF11O14788 317 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 IFNA21P01568 189 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 CD8AP01732 235 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 CD74P04233 296 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ITGB2P05107 769 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 TPT1P13693 172 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF708P17019 499 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 BRS3P32247 399 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 HERPUD1Q15011 391 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 RNF151Q2KHN1 245 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 MST1LQ2TV78 715 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM225Q6GV28 225 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 DNM1P34Q6PK57 102 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 CYB561A3Q8NBI2 242 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC30A7Q8NEW0 376 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 OR1J1Q8NGS3 322 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SMPDL3BQ92485 455 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ISOC2Q96AB3 205 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SMIM12Q96EX1 92 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 DNAJA3Q96EY1 480 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 PRRT1Q99946 306 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 VPS25Q9BRG1 176 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 HCAR1Q9BXC0 346 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 RERGLQ9H628 205 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 MED20Q9H944 212 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A087WV48 116 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1B0GVC2 190 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 DVL2O14641 736 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SYT7O43581 403 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 NDUFB6O95139 128 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 MELTFP08582 738 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 IRF2P14316 349 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF43P17038 809 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SULT1A1P50225 295 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC16A1P53985 500 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CLDN18P56856 261 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 UBE2V2Q15819 145 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TBR1Q16650 682 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 FDX2Q6P4F2 183 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 KCTD9Q7L273 389 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 KIR2DL5AQ8N109 375 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 C11orf42Q8N5U0 333 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 NAXEQ8NCW5 288 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10D3Q8NH80 312 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 KCNK17Q96T54 332 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SULT4A1Q9BR01 284 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SRXN1Q9BYN0 137 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 RGCCQ9H4X1 137 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CBLN4Q9NTU7 201 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CSAG2Q9Y5P2 127 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM8BA6NDV4 472 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM157AC9JC47 383 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 F8VVB4 439 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 F8VWA3 439 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CCSO14618 274 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST1H2BKO60814 126 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST1H2BJP06899 126 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CELA3AP09093 270 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 HLA-DOBP13765 273 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST1H2BOP23527 126 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST1H2BBP33778 126 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 FHITP49789 147 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 PTTG1IPP53801 180 aa6.33□□□□□ -1.4
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