RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 RNF133Q8WVZ7 376 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 C22orf15Q8WYQ4 148 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 HBEGFQ99075 208 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 SFXN3Q9BWM7 321 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 LHX5Q9H2C1 402 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 MMP26Q9NRE1 261 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 HEBP1Q9NRV9 189 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 TAS2R13Q9NYV9 303 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 PSG8Q9UQ74 426 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 TIMM22Q9Y584 194 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 PALLDQ8WX93 1383 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 OR6C70A6NIJ9 312 aa3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 LRRN3E7EW58 273 aa3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
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CCL20-204ENST00000489160 NDUFS5O43920 106 aa3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 MPZL1O95297 269 aa3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 INSP01308 110 aa3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 NQO1P15559 274 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 ATF1P18846 271 aa3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 CELP19835 753 aa3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 TCN2P20062 427 aa3.34□□□□□ -1.87
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CCL20-204ENST00000489160 CXCR1P25024 350 aa3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 PAX6P26367 422 aa3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 COILP38432 576 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 PPOXP50336 477 aa3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 RPL23P62829 140 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 PRSS8Q16651 343 aa3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 OPN5Q6U736 354 aa3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 DRAM2Q6UX65 266 aa3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 C6orf120Q7Z4R8 191 aa3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 GAPTQ8N292 157 aa3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 SUMF2Q8NBJ7 301 aa3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 OR5L1Q8NGL2 311 aa3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 OR10G4Q8NGN3 311 aa3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 PIFOQ8TCI5 191 aa3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 DCAKDQ8WVC6 231 aa3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 DDIT4LQ96D03 193 aa3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 CEP170P1Q96L14 293 aa3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 PGLYRP3Q96LB9 341 aa3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 RBP7Q96R05 134 aa3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 GPR22Q99680 433 aa3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 NRTNQ99748 197 aa3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 TAPBPLQ9BX59 468 aa3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 SLC40A1Q9NP59 571 aa3.34□□□□□ -1.87
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CCL20-204ENST00000489160 SIGLEC7Q9Y286 467 aa3.34□□□□□ -1.87
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CCL20-204ENST00000489160 FHAD1B1AJZ9 1412 aa3.34□□□□□ -1.88
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CCL20-204ENST00000489160 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa3.34□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 CCDC88BA6NC98 1476 aa3.34□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa3.34□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa3.33□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 DAPL1A0PJW8 107 aa3.33□□□□□ -1.88
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CCL20-204ENST00000489160 EFCAB9A8MZ26 197 aa3.33□□□□□ -1.88
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CCL20-204ENST00000489160 PANO1I0J062 215 aa3.33□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 PSPHP1O15172 72 aa3.33□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 DENRO43583 198 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
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CCL20-204ENST00000489160 SLC22A5O76082 557 aa3.33□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 IL6P05231 212 aa3.33□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 BCHEP06276 602 aa3.33□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 ZNF35P13682 527 aa3.33□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 UGT2B7P16662 529 aa3.33□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 AZU1P20160 251 aa3.33□□□□□ -1.88
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CCL20-204ENST00000489160 CXCL5P42830 114 aa3.33□□□□□ -1.88
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CCL20-204ENST00000489160 ADIGQ0VDE8 80 aa3.33□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 ALX1Q15699 326 aa3.33□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 ACTBL2Q562R1 376 aa3.33□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 CLVS2Q5SYC1 327 aa3.33□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 ABHD3Q8WU67 409 aa3.33□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 RNF138Q8WVD3 245 aa3.33□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 FAM19A4Q96LR4 140 aa3.33□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 OR2M2Q96R28 347 aa3.33□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 CGREF1Q99674 301 aa3.33□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 TMEM243Q9BU79 118 aa3.33□□□□□ -1.88
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