RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439009.1

LINC00578-201, long intergenic non-protein coding RNA 578, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LINC00578, Length 542 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00578-201ENST00000439009 CD33P20138 364 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 PAICSP22234 425 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 PAX6P26367 422 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 EPHA2P29317 976 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 PYCR1P32322 319 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 SOX6P35712 828 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 MAP2K4P45985 399 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 SLC15A1P46059 708 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 DYNLT3P51808 116 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 GRB2P62993 217 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 COL10A1Q03692 680 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 ST3GAL4Q11206 333 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 TSPAN31Q12999 210 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 SLC25A30Q5SVS4 291 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 RNLSQ5VYX0 342 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 CALHM1Q8IU99 346 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 MKXQ8IYA7 352 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 LNX2Q8N448 690 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 SDR9C7Q8NEX9 313 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 OR52H1Q8NGJ2 320 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 OR2T4Q8NH00 348 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 TMEM80Q96HE8 168 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 REEP6Q96HR9 211 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 B9D2Q9BPU9 175 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 RTL8AQ9BWD3 113 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 MND1Q9BWT6 205 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 FN3KQ9H479 309 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 C19orf12Q9NSK7 152 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF319Q9P2F9 582 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 TCF19Q9Y242 345 aa6.36□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 A0A1W2PPH5 198 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 ANXA2P2A6NMY6 339 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF878C9JN71 531 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 CCRL2O00421 344 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 MYL12BO14950 172 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 AKR7A2O43488 359 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 TFF1P04155 84 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 HMGN1P05114 100 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 PSG2P11465 335 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 MYL12AP19105 171 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 ACKR3P25106 362 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 S100A5P33763 92 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 GNALP38405 381 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 CX3CR1P49238 355 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 ENTPD1P49961 510 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 SLC25A1P53007 311 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 IRF3Q14653 427 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 TAF13Q15543 124 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 SNAPC1Q16533 368 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 CTF1Q16619 201 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 FTMTQ8N4E7 242 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 MINDY2Q8NBR6 621 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 PROKR2Q8NFJ6 384 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 RPS4Y2Q8TD47 263 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 RNF133Q8WVZ7 376 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 RFKQ969G6 155 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 ITFG2Q969R8 447 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 LGALS12Q96DT0 336 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 MALSU1Q96EH3 234 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 CENPMQ9NSP4 180 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 RASL12Q9NYN1 266 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 IL20Q9NYY1 176 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 TVP23BQ9NYZ1 205 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 A3GALT2U3KPV4 340 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa6.34□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 A0A1W2PPE2 198 aa6.34□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 A0A1W2PR64 198 aa6.34□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 A0A1W2PRV1 198 aa6.34□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.34□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 FAM90A22PA8MWA6 464 aa6.34□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 ODF3BA8MYP8 253 aa6.34□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 PRODHO43272 600 aa6.34□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 TBX1O43435 398 aa6.34□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 PFDN1O60925 122 aa6.34□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 SOX14O95416 240 aa6.34□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 ALDOBP05062 364 aa6.34□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
LINC00578-201ENST00000439009 OPRL1P41146 370 aa6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms