RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428101.6

LMO1-202, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-202ENST00000428101 ENTPD6O75354 484 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO1-202ENST00000428101 INMTO95050 263 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO1-202ENST00000428101 CHRM2P08172 466 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO1-202ENST00000428101 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LMO1-202ENST00000428101 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LMO1-202ENST00000428101 SLC25A26Q70HW3 274 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO1-202ENST00000428101 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LMO1-202ENST00000428101 PIFOQ8TCI5 191 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO1-202ENST00000428101 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LMO1-202ENST00000428101 HRASLS5Q96KN8 279 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO1-202ENST00000428101 NOTCH1P46531 2555 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO1-202ENST00000428101 MEGF11A6BM72 1044 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO1-202ENST00000428101 SERPINA3P01011 423 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO1-202ENST00000428101 SLC25A30Q5SVS4 291 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO1-202ENST00000428101 FAM220AQ7Z4H9 259 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO1-202ENST00000428101 OR2G2Q8NGZ5 317 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO1-202ENST00000428101 BORCS8Q96FH0 119 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO1-202ENST00000428101 IMPAD1Q9NX62 359 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO1-202ENST00000428101 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa22.08■■□□□ 1.13
LMO1-202ENST00000428101 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa22.08■■□□□ 1.13
LMO1-202ENST00000428101 H3BNX3 289 aa22.08■■□□□ 1.13
LMO1-202ENST00000428101 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa22.08■■□□□ 1.13
LMO1-202ENST00000428101 EGFL6Q8IUX8 553 aa22.08■■□□□ 1.13
LMO1-202ENST00000428101 PP6455Q8WZ26 134 aa22.08■■□□□ 1.13
LMO1-202ENST00000428101 RNFT2Q96EX2 444 aa22.08■■□□□ 1.13
LMO1-202ENST00000428101 FRRS1LQ9P0K9 344 aa22.08■■□□□ 1.13
LMO1-202ENST00000428101 SIGLEC9Q9Y336 463 aa22.08■■□□□ 1.13
LMO1-202ENST00000428101 TMEM82A0PJX8 343 aa22.07■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 EI24O14681 340 aa22.07■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 GABRA5P31644 462 aa22.07■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 LGALS4P56470 323 aa22.07■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 TCF23Q7RTU1 214 aa22.07■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 OR8H2Q8N162 312 aa22.07■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 DYNAPQ8N1N2 210 aa22.07■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 DNAAF1Q8NEP3 725 aa22.07■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 SNX22Q96L94 193 aa22.07■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 IL36RNQ9UBH0 155 aa22.07■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 TSPAN15O95858 294 aa22.06■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 ZNF728P0DKX0 622 aa22.06■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 KIR2DS4P43632 304 aa22.06■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 NPBWR2P48146 333 aa22.06■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 EDDM3BP56851 147 aa22.06■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 OR12D2P58182 307 aa22.06■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 TMEM244Q5VVB8 128 aa22.06■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 FDX2Q6P4F2 183 aa22.06■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 GDPD3Q7L5L3 318 aa22.06■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa22.06■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 ODF3BA8MYP8 253 aa22.05■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 RBP4P02753 201 aa22.05■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 ISG15P05161 165 aa22.05■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 RBP2P50120 134 aa22.05■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 EFNB2P52799 333 aa22.05■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 ACTC1P68032 377 aa22.05■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 ACTA1P68133 377 aa22.05■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa22.05■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 UTS2BQ765I0 119 aa22.05■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 FGGYQ96C11 551 aa22.05■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 AASSQ9UDR5 926 aa22.05■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 ORC6Q9Y5N6 252 aa22.05■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 DAPL1A0PJW8 107 aa22.04■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 VGLL3A8MV65 326 aa22.04■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 SLC16A6O15403 523 aa22.04■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 CHST1O43916 411 aa22.04■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 HAND1O96004 215 aa22.04■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 IGHA1P01876 353 aa22.04■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 ATF1P18846 271 aa22.04■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 BCL3P20749 454 aa22.04■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 ALDH3A2P51648 485 aa22.04■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 ATP1B3P54709 279 aa22.04■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 MEDAGQ5VYS4 303 aa22.04■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 Q8IYB0 196 aa22.04■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 OR52N4Q8NGI2 321 aa22.04■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 MBOAT4Q96T53 435 aa22.04■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 RAB18Q9NP72 206 aa22.04■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 ARG1P05089 322 aa22.03■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 IGHV1-8P0DP01 117 aa22.03■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 MTCP1P56278 107 aa22.03■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 ZNF91Q05481 1191 aa22.03■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 EDDM3AQ14507 147 aa22.03■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 OR11H6Q8NGC7 330 aa22.03■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 OR4C13Q8NGP0 309 aa22.03■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 OR13D1Q8NGV5 346 aa22.03■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 OR10AC1Q8NH08 325 aa22.03■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa22.02■■□□□ 1.12
LMO1-202ENST00000428101 PSPNO60542 156 aa22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms