RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365280.1

RNU6-407P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 407, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-407P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-407P-201ENST00000365280 MSR1P21757 451 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 PAX6P26367 422 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 ELK4P28324 431 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 HTR2CP28335 458 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC1A2P43004 574 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 ST3GAL4Q11206 333 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 IL18Q14116 193 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 PMVKQ15126 192 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 RCN1Q15293 331 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 CST6Q15828 149 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 TNXAQ16473 311 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF404Q494X3 552 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 TTC32Q5I0X7 151 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 IDNKQ5T6J7 187 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF567Q8N184 647 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 CYB561A3Q8NBI2 242 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR4K2Q8NGD2 314 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 TNFRSF14Q92956 283 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 NAT6Q93015 286 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 UBE2WQ96B02 151 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 RILPQ96NA2 401 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 YPEL4Q96NS1 127 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR8B2Q96RD0 313 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 C11orf70Q9BRQ4 267 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 CXCL16Q9H2A7 254 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMEM100Q9NV29 134 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 TBC1D24Q9ULP9 559 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 KLF12Q9Y4X4 402 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRAV25A0A0B4J276 109 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A0B4J2C4 111 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 CTAGE15A4D2H0 777 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 C19orf71A6NCJ1 209 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 KNCNA6PVL3 124 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 DFFAO00273 331 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 UPK2O00526 184 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 ISLRO14498 428 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 FFAR1O14842 300 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 PLEKHA8P1O95397 391 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 PDYNP01213 254 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 IGKV1D-33P01593 117 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 IGKV1-33P01594 117 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR5AL1P0C617 328 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 CNTFRP26992 372 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 HCCSP53701 268 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 SSX1Q16384 188 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 BCL2A1Q16548 175 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 TTMPQ5BVD1 217 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 CTAGE6Q86UF2 777 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 HS3ST5Q8IZT8 346 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 KIF2BQ8N4N8 673 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 COMMD1Q8N668 190 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR10D4PQ8NGN7 298 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 NT5CQ8TCD5 201 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 ING5Q8WYH8 240 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 TXNDC17Q9BRA2 123 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMED9Q9BVK6 235 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 SRRQ9GZT4 340 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 VPS37BQ9H9H4 285 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 C6orf50Q9HD87 102 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 ADA2Q9NZK5 511 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 FLVCR2Q9UPI3 526 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 CFL2Q9Y281 166 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 ORC6Q9Y5N6 252 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 INSIG2Q9Y5U4 225 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 LCTP09848 1927 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 LAMB2P55268 1798 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 GATCO43716 136 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 KLK1P06870 262 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 GTF2F2P13984 249 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 CALRP27797 417 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 IMPA1P29218 277 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 CRABP2P29373 138 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 PSG4Q00888 419 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 ULK3Q6PHR2 472 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 VTCN1Q7Z7D3 282 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 PRNTQ86SH4 94 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 NIT1Q86X76 327 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR6K6Q8NGW6 343 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR2V1Q8NHB1 315 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 GLYATL2Q8WU03 294 aa0.47□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms