RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 GPR176Q14439 515 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-212ENST00000491302 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-212ENST00000491302 RNF182Q8N6D2 247 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-212ENST00000491302 OR52N1Q8NH53 320 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-212ENST00000491302 TMIGD2Q96BF3 282 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-212ENST00000491302 SMIM8Q96KF7 97 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-212ENST00000491302 IL37Q9NZH6 218 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-212ENST00000491302 CLEC2DQ9UHP7 191 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM131Q92545 1883 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GW15 77 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 LHBP01229 141 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 CD8AP01732 235 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 GIMD1P0DJR0 217 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 NTF3P20783 257 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 LCN1P31025 176 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 CASQ1P31415 396 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 SLC18A1P54219 525 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 TSPAN5P62079 268 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 TCAIMQ8N3R3 496 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 CCNYL1Q8N7R7 359 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 OR4K2Q8NGD2 314 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM239Q8WW34 195 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF649Q9BS31 505 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 hCG_2039718K7EN88 272 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 ENSAO43768 121 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 CST4P01036 141 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 GUSBP1Q15486 140 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 MED27Q6P2C8 311 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 PDPNQ86YL7 162 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 SPACA5Q96QH8 159 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 CEACAM18A8MTB9 384 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 UPK1AO00322 258 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 CDRT1O95170 752 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV1D-16P01601 117 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 SPAM1P38567 509 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 ATP5G2Q06055 141 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 FAM231DQ6ZW35 169 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 STK40Q8N2I9 435 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 SDHAF3Q9NRP4 125 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 CA10Q9NS85 328 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP4.38□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 KDM6BO15054 1643 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 C9JQL5 133 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 M0QX08 132 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 UPK2O00526 184 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 RTL8CO15255 209 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV1-39P01597 117 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV1D-39P04432 117 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 CD28P10747 220 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 LY6EQ16553 131 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A34Q6PIV7 304 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 NT5DC3Q86UY8 548 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 GAPTQ8N292 157 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 SLC26A10Q8NG04 563 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 YIPF6Q96EC8 236 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 WDR34Q96EX3 536 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 CPB2Q96IY4 423 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 ZFP3Q96NJ6 502 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP4.37□□□□□ -1.711e-7■■■■■ 31.4
PTPRC-212ENST00000491302 TSGA10Q9BZW7 698 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 TMBIM4Q9HC24 238 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 SVILO95425 2214 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 YEATS2Q9ULM3 1422 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 ERICH4A6NGS2 130 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 LGALS9O00182 355 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 XKP51811 444 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 STX3Q13277 289 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 DNLZQ5SXM8 178 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 KCTD16Q68DU8 428 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 IGFL1Q6UW32 110 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 CYP4Z1Q86W10 505 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 OR8G5Q8NG78 346 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 RMI2Q96E14 147 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 PLEKHA1Q9HB21 404 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 ABCB9Q9NP78 766 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 PARP11Q9NR21 331 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 INSIG2Q9Y5U4 225 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 BRWD3Q6RI45 1802 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF98A6NK75 572 aa4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms