RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 HLA-DMAP28067 261 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 TGFBR2P37173 567 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 TGM4P49221 684 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 BIKQ13323 160 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 MFSD14CQ5VZR4 134 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 TMEM236Q5W0B7 351 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 TMEM220Q6QAJ8 160 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 GABRG1Q8N1C3 465 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 JAGN1Q8N5M9 183 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 OR52E5Q8NH55 327 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 OR51F2Q8NH61 342 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 TMEM159Q96B96 161 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 TEAD3Q99594 435 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 CALN1Q9BXU9 219 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 PRO3102Q9H379 93 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 GCNT4Q9P109 453 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 TTC28Q96AY4 2481 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 HTTP42858 3142 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 MROH7Q68CQ1 1323 aa2.68□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 NUP155O75694 1391 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 CDH16O75309 829 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 IGKV1-39P01597 117 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 IGKV1D-39P04432 117 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 HMOX2P30519 316 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 PPP1CAP62136 330 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 KDM4DQ6B0I6 523 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 CHP1Q99653 195 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 EMC6Q9BV81 110 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 ZNF302Q9NR11 478 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 CA10Q9NS85 328 aa2.67□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 ZFHX4Q86UP3 3567 aa2.66□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa2.66□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 ERI3O43414 337 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 RAB5AP20339 215 aa2.66□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 SLC1A2P43004 574 aa2.66□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 PSMD8P48556 350 aa2.66□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 ACOT2P49753 483 aa2.66□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 SLC9A3R2Q15599 337 aa2.66□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 ZNF678Q5SXM1 525 aa2.66□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 CCDC183Q5T5S1 534 aa2.66□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 ASF1BQ9NVP2 202 aa2.66□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 HMGXB4Q9UGU5 601 aa2.66□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 MUC6Q6W4X9 2439 aa2.66□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa2.65□□□□□ -1.98
SGCE-210ENST00000472326 ERLIN1O75477 346 aa2.65□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 DEDDO75618 318 aa2.65□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 MPIP34949 423 aa2.65□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 MERTKQ12866 999 aa2.65□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 TMEM31Q5JXX7 168 aa2.65□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 ZFAND6Q6FIF0 208 aa2.65□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 MCUR1Q96AQ8 359 aa2.65□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 SFXN3Q9BWM7 321 aa2.65□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 MS4A8Q9BY19 250 aa2.65□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 RAB22AQ9UL26 194 aa2.65□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 CACNA1BQ00975 2339 aa2.65□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 MON2Q7Z3U7 1717 aa2.65□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 DLEC1Q9Y238 1755 aa2.64□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 INSRP06213 1382 aa2.64□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 UNC79Q9P2D8 2635 aa2.64□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 NRASP01111 189 aa2.64□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 HRASP01112 189 aa2.64□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 KRASP01116 189 aa2.64□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 IGHV1-46P01743 117 aa2.64□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 HLA-HP01893 362 aa2.64□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 IFNW1P05000 195 aa2.64□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 OR1G1P47890 313 aa2.64□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 WDR82Q6UXN9 313 aa2.64□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 LUZP2Q86TE4 346 aa2.64□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 RAB43Q86YS6 212 aa2.64□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 OR4C13Q8NGP0 309 aa2.64□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa2.64□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 GPR21Q99679 349 aa2.64□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 DUSP21Q9H596 190 aa2.64□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa2.64□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 C5orf42Q9H799 3197 aa2.64□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 CFAP54Q96N23 3096 aa2.63□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 CACNA1SQ13698 1873 aa2.63□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 BCKDKO14874 412 aa2.63□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 CCDC22O60826 627 aa2.63□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 CTNSO60931 367 aa2.63□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 FCN3O75636 299 aa2.63□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 TDP2O95551 362 aa2.63□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 AGTP01019 485 aa2.63□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 IL3RAP26951 378 aa2.63□□□□□ -1.99
SGCE-210ENST00000472326 GZMMP51124 257 aa2.63□□□□□ -1.99
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