RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM246Q9BRR3 403 aa7.4□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.4□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 STUB1Q9UNE7 303 aa7.4□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 SSR3Q9UNL2 185 aa7.4□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 MYO9AB2RTY4 2548 aa7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 CEACAM18A8MTB9 384 aa7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 TRAPPC2LH3BP13 241 aa7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 IGKV1D-12P01611 117 aa7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 TFF1P04155 84 aa7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 RPS2P15880 293 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 GALP22466 123 aa7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 PTGFRP43088 359 aa7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 NPBWR2P48146 333 aa7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 SNU13P55769 128 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 KCNJ8Q15842 424 aa7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 SMIM21Q3B7S5 101 aa7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM155Q4W5P6 130 aa7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 TEX36Q5VZQ5 186 aa7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 LYPD2Q6UXB3 125 aa7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 ACP7Q6ZNF0 438 aa7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 C1QL2Q7Z5L3 287 aa7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 SPICQ8N5J4 248 aa7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 YIPF6Q96EC8 236 aa7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF665Q9H7R5 613 aa7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 SMURF1Q9HCE7 757 aa7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 RASL12Q9NYN1 266 aa7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 NLKQ9UBE8 527 aa7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 ING4Q9UNL4 249 aa7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 ITPR3Q14573 2671 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 SHISA3A0PJX4 238 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 MEGF11A6BM72 1044 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 OR2AT4A6NND4 320 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 TMPRSS2O15393 492 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 CDRT1O95170 752 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 FSTL3O95633 263 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 IGHV2-5P01817 119 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 TFAP2AP05549 437 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 HEXAP06865 529 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 SFTPBP07988 381 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 PSG2P11465 335 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 CD99P14209 185 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 PRKACAP17612 351 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 MYL9P24844 172 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 GABRA2P47869 451 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 ERVK11-1P61568 191 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 LMO4P61968 165 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 LSM3P62310 102 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 RSU1Q15404 277 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM249Q2WGJ8 235 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 GLT8D1Q68CQ7 371 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 STUMQ69YW2 141 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 Q8IYB0 196 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 SAXO1Q8IYX7 474 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 FAM58AQ8N1B3 248 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 OR13F1Q8NGS4 319 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 OR10K1Q8NGX5 313 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 RAB39BQ96DA2 213 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 C18orf12Q96KH6 178 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 S100A13Q99584 98 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 CCL13Q99616 98 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 GFI1Q99684 422 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 CENPOQ9BU64 300 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 FUNDC2Q9BWH2 189 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 RNF167Q9H6Y7 350 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 CNTD2Q9H8S5 307 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 LPAR2Q9HBW0 351 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 HES4Q9HCC6 221 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 IL36RNQ9UBH0 155 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 OR14J1Q9UGF5 321 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa7.37□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa7.37□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 A0A1B0GW55 424 aa7.37□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 SMIM30A4D0T7 59 aa7.37□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 NKX6-3A6NJ46 265 aa7.37□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 RFPL4AA6NLU0 287 aa7.37□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 FAM157AC9JC47 383 aa7.37□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa7.37□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 PDCD5O14737 125 aa7.37□□□□□ -1.23
CASQ1-202ENST00000467691 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms