RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 PNLIPP16233 465 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 HOXA5P20719 270 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 MSR1P21757 451 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 SNU13P55769 128 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 GJC3Q8NFK1 279 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 OR13G1Q8NGZ3 307 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 GNRHR2Q96P88 292 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 PARP11Q9NR21 331 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 EHFQ9NZC4 300 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 ANAPC10Q9UM13 185 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 RTTNQ86VV8 2226 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 CSTBP04080 98 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 FAHP16930 419 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 GLRA1P23415 457 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 RAB32Q13637 225 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 HMGN3Q15651 99 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 PHYHD1Q5SRE7 291 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 RAET1LQ5VY80 246 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 STX12Q86Y82 276 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 FOXRED2Q8IWF2 684 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF565Q8N9K5 539 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 S100PBPQ96BU1 408 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 PIGQQ9BRB3 760 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 CHST5Q9GZS9 411 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 POMT1Q9Y6A1 747 aa11.54□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 NPIPA2E9PIF3 369 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 NPIPA3F8WFD2 350 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 LYL1P12980 280 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 NR2C1P13056 603 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 FPR2P25090 351 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 S100A10P60903 97 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 LSM6P62312 80 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 PIGTQ969N2 578 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 OR10C1Q96KK4 312 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 NELFAQ9H3P2 528 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 GFOD1Q9NXC2 390 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 GSKIPQ9P0R6 139 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 WNT16Q9UBV4 365 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 U3KQA8 63 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 K7ESF4 209 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 SLC31A2O15432 143 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 DKK1O94907 266 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 IFNA17P01571 189 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 S100A2P29034 98 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 UBE2V2Q15819 145 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 ANKRD55Q3KP44 614 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 CHRFAM7AQ494W8 412 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 UCN2Q96RP3 112 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 RAB18Q9NP72 206 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 PIGLQ9Y2B2 252 aa11.53□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 KNG1P01042 644 aa11.52□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 THBS4P35443 961 aa11.52□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 RBP2P50120 134 aa11.52□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 NDUFA6P56556 154 aa11.52□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 TAS2R46P59540 309 aa11.52□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 PCOLCEQ15113 449 aa11.52□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM268Q5VZI3 342 aa11.52□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 LYSMD4Q5XG99 296 aa11.52□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 FAM89BQ8N5H3 189 aa11.52□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 SSC4DQ8WTU2 575 aa11.52□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 PECRQ9BY49 303 aa11.52□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 SLC26A1Q9H2B4 701 aa11.52□□□□□ -0.56
TMOD1-202ENST00000375175 ARGFXA6NJG6 315 aa11.52□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 UMAD1C9J7I0 102 aa11.52□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 NME2P1O60361 137 aa11.52□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 DHRS3O75911 302 aa11.52□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 TSPAN15O95858 294 aa11.52□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 HPNP05981 417 aa11.52□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 DBHP09172 617 aa11.52□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 MIDNQ504T8 468 aa11.52□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 AADACL3Q5VUY0 350 aa11.52□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 OR2A2Q6IF42 318 aa11.52□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC54Q8NEL0 328 aa11.52□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 PLEK2Q9NYT0 353 aa11.52□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 STARD10Q9Y365 291 aa11.52□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 CACNA1EQ15878 2313 aa11.52□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 H7C1Q1 480 aa11.51□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 ONECUT2O95948 504 aa11.51□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 CCL3P10147 92 aa11.51□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 GABRR1P24046 479 aa11.51□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 CTSSP25774 331 aa11.51□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 RPS10P46783 165 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 GUK1Q16774 197 aa11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77 ms