RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 COMMD2Q86X83 199 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 OR6K6Q8NGW6 343 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 BCAS4Q8TDM0 211 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 AQP3Q92482 292 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM162AQ96A26 154 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 OR51I2Q9H344 312 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 FN3KQ9H479 309 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 BRD7Q9NPI1 651 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT84Q9NSB2 600 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 TENM2Q9NT68 2774 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 DHRS12A0PJE2 317 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 K7N7A8 449 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 CXCR6O00574 342 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 LDLRAD4O15165 306 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 E2F6O75461 281 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 TFF1P04155 84 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 PEX2P28328 305 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 VEGFCP49767 419 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 PRRX1P54821 245 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 BDH1Q02338 343 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 KIR2DS1Q14954 304 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC01559Q495D7 138 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF684Q5T5D7 378 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 PLCXD3Q63HM9 321 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC35E3Q7Z769 313 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF429Q86V71 674 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 DRAM1Q8N682 238 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 CD177Q8N6Q3 437 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 RNFT2Q96EX2 444 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 LYZL4Q96KX0 146 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 GHITMQ9H3K2 345 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 BAIAP2Q9UQB8 552 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC22A13Q9Y226 551 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00312Q9Y6C7 94 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 J3QT63 122 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 AP4M1O00189 453 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 FGF16O43320 207 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 GADD45GO95257 159 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ELANEP08246 267 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 HAAOP46952 286 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 NUDT2P50583 147 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 DLX6P56179 175 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 FXYD6P3P58550 94 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 CEP78Q5JTW2 689 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 MOB3CQ70IA8 216 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 OR8H2Q8N162 312 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ABHD12Q8N2K0 398 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00471Q8N535 108 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 OR51L1Q8NGJ5 315 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 OR6N2Q8NGY6 317 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 OR52J3Q8NH60 311 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF133Q8WVZ7 376 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 DDB2Q92466 427 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 MCUR1Q96AQ8 359 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 RAX2Q96IS3 184 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 SNX22Q96L94 193 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 INTS14Q96SY0 518 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ENPP5Q9UJA9 477 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 ARRDC5A6NEK1 342 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 ACOD1A6NK06 481 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 RIIAD1A6NNX1 92 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 CCRL2O00421 344 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 LYNP07948 512 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 OR8U8P0C7N1 319 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5H8P0DN80 308 aa6.21□□□□□ -1.42
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