RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292211.4

UBE2Q1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2Q1, Length 3,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARG1P05089 322 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 NTF4P34130 210 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 PLA2G2CQ5R387 149 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 C9orf135Q5VTT2 229 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 PGAP1Q75T13 922 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 BPIFB2Q8N4F0 458 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM24BQ8N5W8 94 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 RAB3CQ96E17 227 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 LOXL4Q96JB6 756 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 CHST6Q9GZX3 395 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 ABI3Q9P2A4 366 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 RAB27BO00194 218 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 BPNT1O95861 308 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 VSIG10L2P0DP72 767 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 DDTP30046 118 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 PLGLB1Q02325 96 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 ANKRD39Q53RE8 183 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 TMEM104Q8NE00 496 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 SPTSSAQ969W0 71 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 HIST1H2BAQ96A08 127 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 NABP1Q96AH0 204 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 DOCK7Q96N67 2140 aa18.34■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 LDLRAD4O15165 306 aa18.33■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 CELA3AP09093 270 aa18.33■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 DCAF10Q5QP82 559 aa18.33■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 ETFRF1Q6IPR1 90 aa18.33■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 DNM1P46Q6ZS02 220 aa18.33■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 RTN4RL2Q86UN3 420 aa18.33■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 NAXEQ8NCW5 288 aa18.33■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 KLK13Q9UKR3 277 aa18.33■□□□□ 0.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 M0R036 132 aa18.33■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 MPGP29372 298 aa18.33■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 CALCRP30988 508 aa18.33■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF774Q6NX45 483 aa18.33■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 C20orf196Q8IYI0 205 aa18.33■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARMC10Q8N2F6 343 aa18.33■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR2AE1Q8NHA4 323 aa18.33■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 PIGTQ969N2 578 aa18.33■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 S100A13Q99584 98 aa18.33■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 PIGLQ9Y2B2 252 aa18.33■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCSO14618 274 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR1C1Q15619 314 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR5AS1Q8N127 324 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 CEACAM16Q2WEN9 425 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF561Q8N587 486 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 STOML3Q8TAV4 291 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 FREM1Q5H8C1 2179 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 CYTIPO60759 359 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 LCATP04180 440 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 MAJINQ3KP22 176 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 GPR87Q9BY21 358 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 PRRG4Q9BZD6 226 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 POFUT1Q9H488 388 aa18.32■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 RAB6AP20340 208 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 CXADRP78310 365 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF626Q68DY1 528 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 NEU1Q99519 415 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 TMEM59Q9BXS4 323 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 B4GALT7Q9UBV7 327 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 DMXL1Q9Y485 3027 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 HTR5AP47898 357 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 MOB3CQ70IA8 216 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 REC114Q7Z4M0 266 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 LYPD6Q86Y78 171 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR2M7Q8NG81 312 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR6K3Q8NGY3 331 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR14K1Q8NGZ2 314 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 LYZL4Q96KX0 146 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 SPRY4Q9C004 299 aa18.31■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 A0A0A6YYH2 397 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 A6NJ64 397 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 TMEM229BQ8NBD8 167 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 CDC6Q99741 560 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM173AQ9BQD7 235 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 UPB1Q9UBR1 384 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 ASPMQ8IZT6 3477 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 NEURL1O76050 574 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 FCGR2AP12318 317 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 SNAI3Q3KNW1 292 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF260Q3ZCT1 412 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC16A14Q7RTX9 510 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 UQCC1Q9NVA1 299 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 AP4M1O00189 453 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 UBBP0CG47 229 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF32P17041 273 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 SERPINA2P20848 420 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 MAGEA5P43359 124 aa18.3■□□□□ 0.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM27BQ5VT28 67 aa18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms