RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 NLKQ9UBE8 527 aa20.63■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 DUX4Q9UBX2 424 aa20.63■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 RAB26Q9ULW5 256 aa20.63■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 H3BSH0 61 aa20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 MPZP25189 248 aa20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 POC1AQ8NBT0 407 aa20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 SPATA3Q8NHX4 192 aa20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 PP6455Q8WZ26 134 aa20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 TMIGD2Q96BF3 282 aa20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 SNTG1Q9NSN8 517 aa20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 NKX6-3A6NJ46 265 aa20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 OR4C45A6NMZ5 311 aa20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 OR2AT4A6NND4 320 aa20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 GPR37O15354 613 aa20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 SERPINA3P01011 423 aa20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 PGA5P0DJD9 388 aa20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 FPR2P25090 351 aa20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 UBE2V2Q15819 145 aa20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 BTN2A1Q7KYR7 527 aa20.62■□□□□ 0.89
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PMS1-220ENST00000618056 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 CNIH3Q8TBE1 160 aa20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 ST8SIA4Q92187 359 aa20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 MED30Q96HR3 178 aa20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 SUCNR1Q9BXA5 334 aa20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 SLC7A11Q9UPY5 501 aa20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa20.62■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 H0YAE9 185 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 LIMS3P0CW19 117 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 LIMS4P0CW20 117 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 HILS1P60008 231 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 FGF12P61328 243 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 MED21Q13503 144 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 PHC2Q8IXK0 858 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 DMRTB1Q96MA1 342 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 GAFA1Q96PS6 74 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 SLC6A7Q99884 636 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 PKIBQ9C010 78 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 HHLA2Q9UM44 414 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa20.6■□□□□ 0.89
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PMS1-220ENST00000618056 NDUFB3O43676 98 aa20.6■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 SYNGR1O43759 233 aa20.6■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 VENTXO95231 258 aa20.6■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 DCKP27707 260 aa20.6■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 IL13RA1P78552 427 aa20.6■□□□□ 0.89
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PMS1-220ENST00000618056 PSG2P11465 335 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 CAPGP40121 348 aa20.59■□□□□ 0.89
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PMS1-220ENST00000618056 IL24Q13007 206 aa20.59■□□□□ 0.89
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PMS1-220ENST00000618056 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa20.58■□□□□ 0.89
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PMS1-220ENST00000618056 ZFAND2BQ8WV99 257 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 JMJD8Q96S16 334 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-220ENST00000618056 HES4Q9HCC6 221 aa20.58■□□□□ 0.89
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PMS1-220ENST00000618056 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
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PMS1-220ENST00000618056 ANGPTL5Q86XS5 388 aa20.57■□□□□ 0.88
PMS1-220ENST00000618056 ZNF676Q8N7Q3 588 aa20.57■□□□□ 0.88
PMS1-220ENST00000618056 OR51A4Q8NGJ6 313 aa20.57■□□□□ 0.88
PMS1-220ENST00000618056 OR10AC1Q8NH08 325 aa20.57■□□□□ 0.88
PMS1-220ENST00000618056 NPRL2Q8WTW4 380 aa20.57■□□□□ 0.88
PMS1-220ENST00000618056 C22orf15Q8WYQ4 148 aa20.57■□□□□ 0.88
PMS1-220ENST00000618056 SDSLQ96GA7 329 aa20.57■□□□□ 0.88
PMS1-220ENST00000618056 ZNF488Q96MN9 340 aa20.57■□□□□ 0.88
PMS1-220ENST00000618056 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PMS1-220ENST00000618056 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa20.56■□□□□ 0.88
PMS1-220ENST00000618056 TRAV40A0A0B4J280 105 aa20.56■□□□□ 0.88
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