RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447061.2

GAPDHP25-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 25, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP25, Length 1,001 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP25-201ENST00000447061 TMEM91Q6ZNR0 172 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 MOB3CQ70IA8 216 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 GPR141Q7Z602 305 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 CROCCP3Q8IVE0 287 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 MKXQ8IYA7 352 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 PXT1Q8NFP0 134 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 OR10AD1Q8NGE0 317 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 OR13C9Q8NGT0 318 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 ITLN1Q8WWA0 313 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 HPSE2Q8WWQ2 592 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 TIMD4Q96H15 378 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 KCTD7Q96MP8 289 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 SORCS2Q96PQ0 1159 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 MRI1Q9BV20 369 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 TPK1Q9H3S4 243 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 GCM1Q9NP62 436 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 NOX4Q9NPH5 578 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 TPSG1Q9NRR2 321 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 GPR173Q9NS66 373 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 SNTG1Q9NSN8 517 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 IL36GQ9NZH8 169 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 NDUFA13Q9P0J0 144 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 NPTNQ9Y639 398 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 FBN2P35556 2912 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 SONP18583 2426 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 ABCA2Q9BZC7 2435 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 MTORP42345 2549 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 HIVEP2P31629 2446 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 CR1P17927 2039 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 A6NLC8 198 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 SRRM5B3KS81 715 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 CLDN25C9JDP6 229 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 TMEM178BH3BS89 294 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 AIREO43918 545 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 RP2O75695 350 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 NCR1O76036 304 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 GABARAPO95166 117 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 BPNT1O95861 308 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 IGHV4-39P01824 125 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 HPXP02790 462 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 HCKP08631 526 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 UBBP0CG47 229 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 SLC25A16P16260 332 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 CALRP27797 417 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 THBS2P35442 1172 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 CDKN1AP38936 164 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 MAGEB1P43366 347 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 HAAOP46952 286 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 SOX2P48431 317 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 GPM6AP51674 278 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 TMBIM6P55061 237 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 MTCP1P56278 107 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 SCAND1P57086 179 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 CCL8P80075 99 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 PDZK1IP1Q13113 114 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 KISS1Q15726 138 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 FAM189A2Q15884 450 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 SMIM21Q3B7S5 101 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 TMEM155Q4W5P6 130 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 CEP78Q5JTW2 689 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 ELP2Q6IA86 826 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 ASPHD2Q6ICH7 369 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 WDR82Q6UXN9 313 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 ASCL4Q6XD76 172 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 DNM1P46Q6ZS02 220 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 LYPD6Q86Y78 171 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 POC1AQ8NBT0 407 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 SCCPDHQ8NBX0 429 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 Q8NFD4 153 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 OR13C5Q8NGS8 318 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 RAB2BQ8WUD1 216 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 AQP3Q92482 292 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 FAM168AQ92567 244 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 RAB1CQ92928 201 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 TMEM203Q969S6 136 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 FUNDC2Q9BWH2 189 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 DNTTIP1Q9H147 329 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 LIME1Q9H400 295 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 TMEM106BQ9NUM4 274 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 TAS2R4Q9NYW5 299 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 RNF7Q9UBF6 113 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 V9GY05 133 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 PDZD2O15018 2839 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa4.54□□□□□ -1.68
GAPDHP25-201ENST00000447061 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms