RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 TRAV20A0A0B4J274 112 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 A8MV72 311 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 SRRM5B3KS81 715 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 J3QT63 122 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 PLPP2O43688 288 aa12.22□□□□□ -0.45
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SH3BP2-208ENST00000504294 LHBP01229 141 aa12.22□□□□□ -0.45
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SH3BP2-208ENST00000504294 PARP16Q8N5Y8 322 aa12.22□□□□□ -0.45
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SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC90BQ9GZT6 254 aa12.22□□□□□ -0.45
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SH3BP2-208ENST00000504294 GPR173Q9NS66 373 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 CLEC2DQ9UHP7 191 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 PQLC2LA1A4F0 135 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 E9PI62 339 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 GPR37O15354 613 aa12.21□□□□□ -0.45
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SH3BP2-208ENST00000504294 RANBP1P43487 201 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 PPP3R1P63098 170 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 TRAM1Q15629 374 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 CD276Q5ZPR3 534 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 GCSAMQ8N6F7 178 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
SH3BP2-208ENST00000504294 AQP3Q92482 292 aa12.21□□□□□ -0.45
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SH3BP2-208ENST00000504294 YAE1D1Q9NRH1 226 aa12.21□□□□□ -0.45
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SH3BP2-208ENST00000504294 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa12.2□□□□□ -0.46
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SH3BP2-208ENST00000504294 UBE2V2Q15819 145 aa12.2□□□□□ -0.46
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SH3BP2-208ENST00000504294 C11orf53Q8IXP5 236 aa12.2□□□□□ -0.46
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SH3BP2-208ENST00000504294 MED13LQ71F56 2210 aa12.19□□□□□ -0.46
SH3BP2-208ENST00000504294 CEACAM18A8MTB9 384 aa12.19□□□□□ -0.46
SH3BP2-208ENST00000504294 SULT1B1O43704 296 aa12.19□□□□□ -0.46
SH3BP2-208ENST00000504294 ECDO95905 644 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
SH3BP2-208ENST00000504294 ALDOBP05062 364 aa12.19□□□□□ -0.46
SH3BP2-208ENST00000504294 CELP19835 753 aa12.19□□□□□ -0.46
SH3BP2-208ENST00000504294 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
SH3BP2-208ENST00000504294 BMXP51813 675 aa12.19□□□□□ -0.46
SH3BP2-208ENST00000504294 GNB2P62879 340 aa12.19□□□□□ -0.46
SH3BP2-208ENST00000504294 IRF3Q14653 427 aa12.19□□□□□ -0.46
SH3BP2-208ENST00000504294 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
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