RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 HNF4GQ14541 408 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 PHLDA2Q53GA4 152 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 PHYHD1Q5SRE7 291 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 OR2AK2Q8NG84 335 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 OR9K2Q8NGE7 335 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 HGDQ93099 445 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 CST11Q9H112 138 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A087X0M5 115 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1B0GX30 115 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 NDUFB6O95139 128 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 RPA2P15927 270 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF32P17041 273 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 IL11RAQ14626 422 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 CDCP2Q5VXM1 449 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 FNDC9Q8TBE3 224 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 DCUN1D4Q92564 292 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 PCK2Q16822 640 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 ISXQ2M1V0 245 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 CLEC1AQ8NC01 280 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 OR10A2Q9H208 303 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 RAB22AQ9UL26 194 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A087WZY1 265 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A0A6YYH2 397 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A0B4J2A0 478 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 A6NJ64 397 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 CLDN23Q96B33 292 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 SRXN1Q9BYN0 137 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 G6PC2Q9NQR9 355 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 SHPKQ9UHJ6 478 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 KLK13Q9UKR3 277 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 IFNA17P01571 189 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 ZP1P60852 638 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 RNF133Q8WVZ7 376 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 TWSG1Q9GZX9 223 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 EML6Q6ZMW3 1958 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 MED13LQ71F56 2210 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 BET1O15155 118 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 PRAF2O60831 178 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 ANOS1P23352 680 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 IGFBP7Q16270 282 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 SP6Q3SY56 376 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 ZBTB37Q5TC79 503 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 TERB2Q8NHR7 220 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 NPIPB7O75200 414 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 COX6A1P12074 109 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 MGMTP16455 207 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 AKR1C3P42330 323 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 LUMP51884 338 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 PPP1R1AQ13522 171 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 KISS1Q15726 138 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 C1QL2Q7Z5L3 287 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 B3GAT1Q9P2W7 334 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 C5orf49A4QMS7 147 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 CBR3O75828 277 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 MAGEA5P43359 124 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF441Q8N8Z8 693 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 IL1F10Q8WWZ1 152 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 FOXJ2Q9P0K8 574 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 LNP1A1A4G5 178 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 TCF21O43680 179 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 PPP3CBP16298 524 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 PER3P56645 1201 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF684Q5T5D7 378 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 H3F3CQ6NXT2 135 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 GLRX5Q86SX6 157 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 EDEM2Q9BV94 578 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 MEIKINA0A087WXM9 373 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 SMCO3A2RU48 225 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 ADAP1O75689 374 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 PGA4P0DJD7 388 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 PGA3P0DJD8 388 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 LIFP15018 202 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 ZXDAP98168 799 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 TEX261Q6UWH6 196 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 SSX7Q7RTT5 188 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 FAAP24Q9BTP7 215 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 ZFP64Q9NPA5 681 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 U3KQ87 197 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 SNAPINO95295 136 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 PMP22Q01453 160 aa11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms