RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 SPEGQ15772 3267 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRC-201ENST00000348564 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 SERPINE3A8MV23 424 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRC-201ENST00000348564 MS4A18Q3C1V0 323 aa3.81□□□□□ -1.8
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PTPRC-201ENST00000348564 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
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PTPRC-201ENST00000348564 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0U1RQK1 487 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF320A2RRD8 509 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 ACOD1A6NK06 481 aa3.81□□□□□ -1.8
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