RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa18.79■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 PCMT1P22061 227 aa18.79■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 USF1P22415 310 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 HAAOP46952 286 aa18.79■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 GPR50Q13585 617 aa18.79■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 TPBGQ13641 420 aa18.79■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 WDR82Q6UXN9 313 aa18.79■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 MS4A15Q8N5U1 240 aa18.79■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC29Q8WV35 223 aa18.79■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 TAS2R4Q9NYW5 299 aa18.79■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 WNT9BO14905 357 aa18.78■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 CPEP16870 476 aa18.78■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 PRKACBP22694 351 aa18.78■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 BTG1P62324 171 aa18.78■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 ARMCX4Q5H9R4 360 aa18.78■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF573Q86YE8 665 aa18.78■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 C19orf18Q8NEA5 215 aa18.78■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 FCGR1BQ92637 280 aa18.78■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM203Q969S6 136 aa18.78■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 ORAI1Q96D31 301 aa18.78■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 F8P00451 2351 aa18.78■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 A0A096LNT2 108 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1W2PPK0 400 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF879B4DU55 563 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 SULT1B1O43704 296 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 PSMB9P28065 219 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 RBP2P50120 134 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 ZMYND11Q15326 602 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 UBE2UQ5VVX9 321 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 ANGPTL5Q86XS5 388 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 GCSAMQ8N6F7 178 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 TSPAN14Q8NG11 270 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 SPSB1Q96BD6 273 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 DOCK11Q5JSL3 2073 aa18.77■□□□□ 0.6
HOXD4-201ENST00000306324 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa18.77■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 PPIAL4EA0A075B759 164 aa18.77■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 PPIAL4DF5H284 164 aa18.77■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 RHBDL1O75783 438 aa18.77■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 IGHV2-70P01814 119 aa18.77■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 HCKP08631 526 aa18.77■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 PPIAL4FP0DN26 164 aa18.77■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 CD99P14209 185 aa18.77■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 RAB3AP20336 220 aa18.77■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 ATP1B3P54709 279 aa18.77■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 GMFBP60983 142 aa18.77■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 INSL4Q14641 139 aa18.77■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 ASPHD2Q6ICH7 369 aa18.77■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 CALHM1Q8IU99 346 aa18.77■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 PHC2Q8IXK0 858 aa18.77■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 DNAAF1Q8NEP3 725 aa18.77■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 AQP3Q92482 292 aa18.77■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 SPACA5Q96QH8 159 aa18.77■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 GAL3ST1Q99999 423 aa18.77■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 NEK6Q9HC98 313 aa18.77■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 PPIAL4AQ9Y536 164 aa18.77■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 C3orf80F5H4A9 247 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 J3QT63 122 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 PLATP00750 562 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 EGR1P18146 543 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 CD80P33681 288 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 MTCP1P56278 107 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 RPS25P62851 125 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 PPP3R1P63098 170 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 NEDD8Q15843 81 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 ACSM3Q53FZ2 586 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 DEFB108BQ8NET1 73 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 CLDND2Q8NHS1 167 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF671Q8TAW3 534 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 C18orf12Q96KH6 178 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 COX4I2Q96KJ9 171 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 DERL3Q96Q80 235 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 TMUB1Q9BVT8 246 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF696Q9H7X3 374 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 CKLFQ9UBR5 152 aa18.76■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 ABCA2Q9BZC7 2435 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 A0A087WXM4 84 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 AKR7A2O43488 359 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 SYNGR1O43759 233 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 INMTO95050 263 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 MDH2P40926 338 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 OR51A2Q8NGJ7 313 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 OR10Z1Q8NGY1 313 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 THRSPQ92748 146 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 RFT1Q96AA3 541 aa18.75■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 ABCA1O95477 2261 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 MAGEB3O15480 346 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 ALX3O95076 343 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 LHBP01229 141 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 CFHR2P36980 270 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXD4-201ENST00000306324 TRAM1Q15629 374 aa18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms