RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576221.1

PCTP-208, Transcript of phosphatidylcholine transfer protein, humanhuman

TSL 5

Gene PCTP, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCTP-208ENST00000576221 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa6.7□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 GCM1Q9NP62 436 aa6.7□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 ISYNA1Q9NPH2 558 aa6.7□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.7□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 TMEM106BQ9NUM4 274 aa6.7□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 CKLFQ9UBR5 152 aa6.7□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 CACNG2Q9Y698 323 aa6.7□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 MED13LQ71F56 2210 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 A0A087WXM4 84 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 A0A1B0GWJ7 208 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 CDIPTO14735 213 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 CYB5AP00167 134 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 CD1AP06126 327 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 HEXAP06865 529 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 HCKP08631 526 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 ATF1P18846 271 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 RAB3AP20336 220 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 HAAOP46952 286 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 FUT6P51993 359 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 ATP1B3P54709 279 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 ZNF154Q13106 437 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 GPR50Q13585 617 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 MPPED2Q15777 294 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 Q499Y3 187 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 SPRNQ5BIV9 151 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 AVPI1Q5T686 147 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 Q6ZSR3 168 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 ZNF573Q86YE8 665 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 TSPAN14Q8NG11 270 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 OR1M1Q8NGA1 313 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 ZNF671Q8TAW3 534 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 TMEM106AQ96A25 262 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 ITPKCQ96DU7 683 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 TMED9Q9BVK6 235 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 REG4Q9BYZ8 158 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 RNF7Q9UBF6 113 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 FBN3Q75N90 2809 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.69□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 ARID1AO14497 2285 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 PPIAL4EA0A075B759 164 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 A0A1W2PPK0 400 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 LRP5LA4QPB2 252 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 TRIM64A6NGJ6 449 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 TRIM64BA6NI03 449 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 ZNF879B4DU55 563 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 RNF223E7ERA6 249 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 PPIAL4DF5H284 164 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 TMEM178BH3BS89 294 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 PPIAL4FP0DN26 164 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 CPEP16870 476 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 GIFP27352 417 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 THBS2P35442 1172 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 TGFBR2P37173 567 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 NR4A2P43354 598 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 GATA4P43694 442 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 RBP2P50120 134 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 MTCP1P56278 107 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 TRAM1Q15629 374 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 UBE2V2Q15819 145 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 NEDD8Q15843 81 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 ACSM3Q53FZ2 586 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 ARMCX4Q5H9R4 360 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 TMEM42Q69YG0 159 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 ZNF826PQ6ZT77 177 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 UTS2BQ765I0 119 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 KRT74Q7RTS7 529 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 SATL1Q86VE3 508 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 PARP16Q8N5Y8 322 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 OR13C5Q8NGS8 318 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 OR13C9Q8NGT0 318 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 RPS4Y2Q8TD47 263 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 TMEM203Q969S6 136 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 SPSB1Q96BD6 273 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 PGLYRP3Q96LB9 341 aa6.68□□□□□ -1.34
PCTP-208ENST00000576221 OPALINQ96PE5 141 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms