RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560272.1

LINS1-208, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 2

Gene LINS1, Length 558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-208	ENST00000560272	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	OR2T29	Q8NH02	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	OTOS	Q8NHW6	89 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	PIGC	Q92535	297 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	RNF170	Q96K19	258 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	LRGUK	Q96M69	825 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	PKP2	Q99959	881 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	C16orf95	Q9H693	158 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	NIPAL2	Q9H841	368 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	DUX4	Q9UBX2	424 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	OR2AT4	A6NND4	320 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272		B2RBV5	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272		H0YAE9	185 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	GNGT2	O14610	69 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	SIGLEC5	O15389	551 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	PRODH	O43272	600 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	AKR7A2	O43488	359 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	ATP8B1	O43520	1251 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	FCN3	O75636	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	TSPAN9	O75954	239 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	HMGN1	P05114	100 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	CSF1	P09603	554 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	RAP2A	P10114	183 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	GLRA1	P23415	457 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	GABRA5	P31644	462 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	SAA4	P35542	130 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	GABRA2	P47869	451 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	CAPZA1	P52907	286 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	CAV3	P56539	151 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	EGR3	Q06889	387 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	KLHL12	Q53G59	568 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	LCN8	Q6JVE9	175 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272		Q6ZTK2	550 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	COMMD2	Q86X83	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	FGFRL1	Q8N441	504 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272		Q8N7P7	452 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	GIPC3	Q8TF64	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	THEM6	Q8WUY1	208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	ITFG2	Q969R8	447 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	SEH1L	Q96EE3	360 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	GAFA1	Q96PS6	74 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	AMELY	Q99218	206 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	FEV	Q99581	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	PPA2	Q9H2U2	334 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	MED20	Q9H944	212 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	RAB18	Q9NP72	206 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	NLK	Q9UBE8	527 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINS1-208	ENST00000560272		A0A1W2PPE2	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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