RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550379.1

RNF41-208, Transcript of ring finger protein 41, human

TSL 3

Gene RNF41, Length 525 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF41-208	ENST00000550379	THBS2	P35442	1172 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	SOX6	P35712	828 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	MPV17	P39210	176 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	PPOX	P50336	477 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	BMX	P51813	675 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ZP1	P60852	638 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	IL24	Q13007	206 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	GPR176	Q14439	515 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	INSL4	Q14641	139 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	SPCS2	Q15005	226 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	KISS1	Q15726	138 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	DGUOK	Q16854	277 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379		Q8TCH9	128 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	AP3S1	Q92572	193 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	SLC25A28	Q96A46	364 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	GFI1	Q99684	422 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ABCG5	Q9H222	651 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	POFUT1	Q9H488	388 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	TMEM100	Q9NV29	134 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ETV7	Q9Y603	341 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	CACNA1D	Q01668	2161 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379		A0A0A6YYH2	397 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	PLSCR5	A0PG75	271 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	LRP5L	A4QPB2	252 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379		A6NJ64	397 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	POM121C	A8CG34	1229 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	C17orf100	A8MU93	164 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379		H7C417	338 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	OVOL3	O00110	214 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	MAGEB3	O15480	346 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	CDRT1	O95170	752 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	CLDN1	O95832	211 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	BMP4	P12644	408 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	RAB6A	P20340	208 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	CPT2	P23786	658 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ETV6	P41212	452 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	MNDA	P41218	407 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	PTGFR	P43088	359 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	SOX2	P48431	317 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	SERPINB10	P48595	397 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	FABP6	P51161	128 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ATP1B3	P54709	279 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ERVS71-1	P61550	626 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ERVK11-1	P61568	191 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	QRFP	P83859	136 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	PRDX4	Q13162	271 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	AGAP6	Q5VW22	663 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	OR2T2	Q6IF00	324 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379		Q6ZR03	302 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	COMMD2	Q86X83	199 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379		Q8IYB0	196 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	FBXW5	Q969U6	566 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	WDFY2	Q96P53	400 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	MICU1	Q9BPX6	476 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		6.54	□□□□□ -1.36

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