RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 SSTP61278 116 aa8.06□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 QRFPP83859 136 aa8.06□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 RNF212Q495C1 297 aa8.06□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 MIDNQ504T8 468 aa8.06□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 PLAC9Q5JTB6 97 aa8.06□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 TMEM268Q5VZI3 342 aa8.06□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 MED25Q71SY5 747 aa8.06□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 C9orf40Q8IXQ3 194 aa8.06□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 DEFB124Q8NES8 71 aa8.06□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 PFDN5Q99471 154 aa8.06□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.06□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 G6PC2Q9NQR9 355 aa8.06□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 FBXL17Q9UF56 701 aa8.06□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 A0A1B0GV90 55 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 SOCS1O15524 211 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 SFT2D2O95562 160 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 HLA-DOBP13765 273 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 IL11P20809 199 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 GLRA1P23415 457 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 HTR5AP47898 357 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 C1orf100Q5SVJ3 147 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 FNDC7Q5VTL7 733 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 ZNF615Q8N8J6 731 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 WDSUB1Q8N9V3 476 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 POC1AQ8NBT0 407 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 OR13C9Q8NGT0 318 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 PMM1Q92871 262 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 ERGIC1Q969X5 290 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 LRFN3Q9BTN0 628 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 SLC26A1Q9H2B4 701 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 PRSS37A4D1T9 235 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 G3V3Y1 287 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 AP4M1O00189 453 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 GPR37O15354 613 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 DDAH2O95865 285 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 HEXBP07686 556 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 LYL1P12980 280 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 MPZP25189 248 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 GNALP38405 381 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 SULT1A1P50225 295 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 SLC37A1P57057 533 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 TCF15Q12870 199 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 TMEM128Q5BJH2 165 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 METTL21AQ8WXB1 218 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 NAT6Q93015 286 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 IER2Q9BTL4 223 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 BANF2Q9H503 90 aa8.05□□□□□ -1.12
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THBS3-211ENST00000541990 GPR132Q9UNW8 380 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 RELNP78509 3460 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 SHISA8B8ZZ34 492 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 XKRYO14609 159 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 CD37P11049 281 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 ZNF708P17019 499 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
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THBS3-211ENST00000541990 P2RY4P51582 365 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 ROM1Q03395 351 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 ZNF616Q08AN1 781 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 PCK2Q16822 640 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 ZNF383Q8NA42 475 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 SUMF1Q8NBK3 374 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 OR52N5Q8NH56 324 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 ZNF721Q8TF20 911 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa8.04□□□□□ -1.12
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THBS3-211ENST00000541990 OR52A1Q9UKL2 312 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 RFNGQ9Y644 331 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 MED13Q9UHV7 2174 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 RTTNQ86VV8 2226 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 METTL21EPA6NDL7 271 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 CXorf65A6NEN9 183 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 H0YIG0 161 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 ZNF264O43296 627 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 BGLAPP02818 100 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 PNMTP11086 282 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 RPS2P15880 293 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 IL15RAQ13261 267 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 RHBDD2Q6NTF9 364 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 DCXRQ7Z4W1 244 aa8.04□□□□□ -1.12
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