RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 M0R1X1 148 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV3-25P01717 112 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 BGNP21810 368 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 CDC20Q12834 499 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 OR13G1Q8NGZ3 307 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 SFXN5Q8TD22 340 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM159Q96B96 161 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00477Q96M19 166 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 RHOXF2Q9BQY4 288 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 SYT4Q9H2B2 425 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 VAX2Q9UIW0 290 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 C2orf16Q68DN1 1984 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 VAPBO95292 243 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 MPZL1O95297 269 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 MLF1P58340 268 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 XIAPP98170 497 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 PITPNAQ00169 270 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO48Q5FWF7 155 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 OR8K3Q8NH51 312 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 ESR2Q92731 530 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 CFAP53Q96M91 514 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 ALS2CR12Q96Q35 445 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 CBY1Q9Y3M2 126 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC42Q9Y546 428 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 ARAP1Q96P48 1450 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF850A8MQ14 1090 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 SCO1O75880 301 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 IL4P05112 153 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 PRLHRP49683 370 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 IFFO1Q0D2I5 559 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFAF6Q330K2 333 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 FAM27D1Q5T7N8 215 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF880Q6PDB4 577 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 SYS1Q8N2H4 156 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 OR5T1Q8NG75 326 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 OR4M2Q8NGB6 313 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 C18orf15Q96N68 181 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 NUDT9Q9BW91 350 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 C21orf62Q9NYP8 219 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 SLC7A11Q9UPY5 501 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 TSPOAP1O95153 1857 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV40A0A0B4J280 105 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 APOA1P02647 267 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 PRSS3P35030 304 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 TAL2Q16559 108 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 Q3ZCU0 254 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 HHATQ5VTY9 493 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 CA13Q8N1Q1 262 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 OR6K2Q8NGY2 324 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 NDNFQ8TB73 568 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 TIMM29Q9BSF4 260 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM100Q9NV29 134 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 VAPAQ9P0L0 249 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD12Q6UB98 2062 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF879B4DU55 563 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC22O60826 627 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 PSMB5P28074 263 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 ATP5J2P56134 94 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 KDM4DQ6B0I6 523 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 CYB561A3Q8NBI2 242 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 CACNG8Q8WXS5 425 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 ULBP2Q9BZM5 246 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 TFR2Q9UP52 801 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 RAB19A4D1S5 217 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 J3QT63 122 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 RRP8O43159 456 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 PRKACBP22694 351 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 GALR1P47211 349 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 PSMB2P49721 201 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 RGS6P49758 472 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 LIN9Q5TKA1 542 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 FAM222AQ5U5X8 452 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 SPERTQ8NA61 448 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 CDKL2Q92772 493 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 RAB1BQ9H0U4 201 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 STMN3Q9NZ72 180 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 RAB23Q9ULC3 237 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 AP3M1Q9Y2T2 418 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-212ENST00000491302 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa4.52□□□□□ -1.69
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