RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 MEMO1Q9Y316 297 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 CFAP54Q96N23 3096 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF878C9JN71 531 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 NPIPB7O75200 414 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 DEDDO75618 318 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 IFNA17P01571 189 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 NTSR1P30989 418 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 CDAP32320 146 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 PLCXD2Q0VAA5 305 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 GGNBP1Q5YKI7 109 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 C1QL2Q7Z5L3 287 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 OR10H5Q8NGA6 315 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 OR56B1Q8NGI3 324 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 OR51T1Q8NGJ9 327 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 OR1J1Q8NGS3 322 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 GNRHR2Q96P88 292 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 KCNJ16Q9NPI9 418 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF319Q9P2F9 582 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 SRPK3Q9UPE1 567 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 POLR1DQ9Y2S0 133 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 MS4A18H0YCH9 400 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 ST8SIA5O15466 376 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 RAMP1O60894 148 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 OR2C1O95371 312 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 SELLP14151 372 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 GABRA4P48169 554 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 HSD17B7P56937 341 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 DEFA6Q01524 100 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 MS4A18Q3C1V0 323 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF343Q6P1L6 599 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 APCDD1LQ8NCL9 501 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF248Q8NDW4 579 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 SGK3Q96BR1 496 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 REEP6Q96HR9 211 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 CHST5Q9GZS9 411 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 H7C1Q1 480 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 GPR37O15354 613 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 HPNP05981 417 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 CHRM2P08172 466 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 SERPINA2P20848 420 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 LMO1P25800 156 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 SHHQ15465 462 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 Q3ZCU0 254 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 CHRFAM7AQ494W8 412 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 OPN5Q6U736 354 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 HEPN1Q6WQI6 88 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 ASB10Q8WXI3 467 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 FGF14Q92915 247 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 SLAMF9Q96A28 289 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 ADIPOR1Q96A54 375 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 C5orf34Q96MH7 638 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 ARV1Q9H2C2 271 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 GPR84Q9NQS5 396 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 C19orf12Q9NSK7 152 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 SOHLH2Q9NX45 425 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 C5orf63A6NC05 138 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 FRG2CA6NGY1 282 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 C5orf67F2Z3F1 127 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 H3BML4 177 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 EFNA3P52797 238 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 RAB1AP62820 205 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 TSPO2Q5TGU0 170 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 PARM1Q6UWI2 310 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 C9orf40Q8IXQ3 194 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 UBAC2Q8NBM4 344 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 KCNG3Q8TAE7 436 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC46A1Q96NT5 459 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 VDAC3Q9Y277 283 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 MYO7BQ6PIF6 2116 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 DANCRP0C864 163 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 BIDP55957 195 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 GFI1BQ5VTD9 330 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 PLXDC2Q6UX71 529 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM213BQ8TBF2 198 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 RHBDD1Q8TEB9 315 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 C14orf144Q96I85 54 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 SCGB3A2Q96PL1 93 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 PIGQQ9BRB3 760 aa11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms