RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 CD1AP06126 327 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 CD2P06729 351 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 CSF3P09919 207 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 CPEP16870 476 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 PMELP40967 661 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 GATA4P43694 442 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 DSCR9P59020 149 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 RPS25P62851 125 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF154Q13106 437 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 GPR50Q13585 617 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 TPBGQ13641 420 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 INSL4Q14641 139 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 Q499Y3 187 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 PRSS57Q6UWY2 283 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 DNM1P46Q6ZS02 220 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF826PQ6ZT77 177 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 SERPINA12Q8IW75 414 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 OR1M1Q8NGA1 313 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 OR5A2Q8NGI9 324 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 OR13C9Q8NGT0 318 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 C10orf105Q8TEF2 133 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 FCGR1BQ92637 280 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM106AQ96A25 262 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 ORAI1Q96D31 301 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 CHODLQ9H9P2 273 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 FN3KRPQ9HA64 309 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 ISYNA1Q9NPH2 558 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 DLL4Q9NR61 685 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM106BQ9NUM4 274 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 C1orf123Q9NWV4 160 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 TAS2R4Q9NYW5 299 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 SLC7A11Q9UPY5 501 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 NOTCH2Q04721 2471 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 PQLC2LA1A4F0 135 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM210A6NLX4 147 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 LRRC30A6NM36 301 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF879B4DU55 563 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 CLDN25C9JDP6 229 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 CDIPTO14735 213 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 SULT1B1O43704 296 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF205O95201 554 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 PLATP00750 562 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 IRF2P14316 349 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 ATF1P18846 271 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 FUT6P51993 359 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 GNG3P63215 75 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 RIN1Q13671 783 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 SSX1Q16384 188 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 ACSM3Q53FZ2 586 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 AVPI1Q5T686 147 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 ASPHD2Q6ICH7 369 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 UTS2BQ765I0 119 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 CEACAM19Q7Z692 300 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 PHC2Q8IXK0 858 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 C11orf53Q8IXP5 236 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 MS4A15Q8N5U1 240 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 PARP16Q8N5Y8 322 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 SCCPDHQ8NBX0 429 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 OR5D14Q8NGL3 314 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 OR11L1Q8NGX0 322 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 ERGIC1Q969X5 290 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 BORCS8Q96FH0 119 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 TECTBQ96PL2 329 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 SPACA5Q96QH8 159 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 BPESC1Q9GZL8 116 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 OR51I2Q9H344 312 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 NARFLQ9H6Q4 476 aa7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa7.44□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa7.44□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 ISPDA4D126 451 aa7.44□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 LRP5LA4QPB2 252 aa7.44□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 RNF223E7ERA6 249 aa7.44□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM178BH3BS89 294 aa7.44□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 NDUFS8O00217 210 aa7.44□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 RHBDL1O75783 438 aa7.44□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 HCKP08631 526 aa7.44□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 RAB3AP20336 220 aa7.44□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 PRKACBP22694 351 aa7.44□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 GIFP27352 417 aa7.44□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 GABRA5P31644 462 aa7.44□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 NR4A2P43354 598 aa7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms