RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARPC2O15144 300 aa10.73□□□□□ -0.69
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT36O76013 467 aa10.73□□□□□ -0.69
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSD17B1P14061 328 aa10.73□□□□□ -0.69
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TIGD4Q8IY51 512 aa10.7□□□□□ -0.7
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PGAM4Q8N0Y7 254 aa10.7□□□□□ -0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNRF1Q8ND25 227 aa10.7□□□□□ -0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa10.69□□□□□ -0.7
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XPNPEP2O43895 674 aa10.69□□□□□ -0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RHBDL1O75783 438 aa10.69□□□□□ -0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSG2P11465 335 aa10.69□□□□□ -0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GSTT1P30711 240 aa10.69□□□□□ -0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MKXQ8IYA7 352 aa10.69□□□□□ -0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LYG1Q8N1E2 194 aa10.69□□□□□ -0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DTX3Q8N9I9 347 aa10.69□□□□□ -0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LYZL4Q96KX0 146 aa10.69□□□□□ -0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MED20Q9H944 212 aa10.69□□□□□ -0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CMC2Q9NRP2 79 aa10.69□□□□□ -0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C19orf12Q9NSK7 152 aa10.69□□□□□ -0.7
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLCEO94923 617 aa10.68□□□□□ -0.7
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