RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317118.12

PDE4D-202, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-202ENST00000317118 RNF115Q9Y4L5 304 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 HCFC1P51610 2035 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 RELNP78509 3460 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 A0A087X0M5 115 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 A0A1B0GX30 115 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 CCDC160A6NGH7 325 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 GGT3PA6NGU5 568 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 SIAH2O43255 324 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 RAB3AP20336 220 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 SOX2P48431 317 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 SPOCK1Q08629 439 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 SPCS2Q15005 226 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 LRRTM1Q86UE6 522 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 LYPD6Q86Y78 171 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 DNAAF1Q8NEP3 725 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 OR1M1Q8NGA1 313 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 SYNPRQ8TBG9 265 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 UBASH3BQ8TF42 649 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 SPSB1Q96BD6 273 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 DCSTAMPQ9H295 470 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 CYSLTR2Q9NS75 346 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 CA10Q9NS85 328 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 TAS2R3Q9NYW6 316 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 CBY1Q9Y3M2 126 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 SHISA3A0PJX4 238 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 GMDSO60547 372 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 LMX1BO60663 402 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 CDRT1O95170 752 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 RNF224P0DH78 156 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 PRF1P14222 555 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 FAHP16930 419 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 CTRB1P17538 263 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 ATF1P18846 271 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 RAB3BP20337 219 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 SDC2P34741 201 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 RPS19P39019 145 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 MPV17P39210 176 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 MAGEB1P43366 347 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 SERPINB10P48595 397 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 SELENOVP59797 346 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 ERVS71-1P61550 626 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 LSM3P62310 102 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 PPP3R1P63098 170 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 EFNB3Q15768 340 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 FAM27D1Q5T7N8 215 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 CTRB2Q6GPI1 263 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 OR8G5Q8NG78 346 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 SLC25A46Q96AG3 418 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 TXN2Q99757 166 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 AIFM2Q9BRQ8 373 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 MRI1Q9BV20 369 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 RNF167Q9H6Y7 350 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 SPACA1Q9HBV2 294 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 TMEM138Q9NPI0 162 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 TAS2R4Q9NYW5 299 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 ATP23Q9Y6H3 246 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 A3GALT2U3KPV4 340 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 NOTOA8MTQ0 251 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 CIDEAO60543 219 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 NRASP01111 189 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 ADRA2CP18825 462 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 BDKRB2P30411 391 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 FUT6P51993 359 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 UBE2V2Q15819 145 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 ADIPOQQ15848 244 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 CEACAM21Q3KPI0 293 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 SPATA46Q5T0L3 261 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 OR2T2Q6IF00 324 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 OR5AS1Q8N127 324 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 ZBTB34Q8NCN2 500 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 OR5A2Q8NGI9 324 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 NDNFQ8TB73 568 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 DHRS9Q9BPW9 319 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 SLC30A2Q9BRI3 323 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 OR51B6Q9H340 312 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 C12orf4Q9NQ89 552 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 GPR160Q9UJ42 338 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 A0A0G2JK05 382 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 A0A1W2PPK0 400 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 OR5B21A6NL26 309 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 A6NNC1 897 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-202ENST00000317118 PRSS44E7EML9 344 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms