RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	UPK3A	O75631	287 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	IGHE	P01854	428 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	FBXO45	P0C2W1	286 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	COX6A1	P12074	109 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	PAX1	P15863	534 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	LPAR6	P43657	344 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	EXT1	Q16394	746 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	GRINA	Q7Z429	371 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM234	Q8WY98	164 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM106A	Q96A25	262 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	FKRP	Q9H9S5	495 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	PADI1	Q9ULC6	663 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1W2PR64	198 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1W2PRV1	198 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	C2orf72	A6NCS6	295 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659		M0QYG6	137 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659		M0R036	132 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	LY86	O95711	162 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	NME2	P22392	152 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	SOX2	P48431	317 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	SULT1A1	P50225	295 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	EFNB2	P52799	333 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	M1AP	Q8TC57	530 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	RAB24	Q969Q5	203 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	RASL10B	Q96S79	203 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	RNF126	Q9BV68	326 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	CST11	Q9H112	138 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	RAB18	Q9NP72	206 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	PISD	Q9UG56	409 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	TTC28	Q96AY4	2481 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	FRYL	O94915	3013 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	BTBD17	A6NE02	478 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	BGLAP	P02818	100 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	RD3L	P0DJH9	198 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	SLC25A1	P53007	311 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	OR2B8P	P59922	312 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	PLA2G7	Q13093	441 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	ALG10	Q5BKT4	473 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	FAM166A	Q6J272	317 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	OR5R1	Q8NH85	324 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	SLC6A7	Q99884	636 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	DDA1	Q9BW61	102 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	MPDZ	O75970	2070 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659		A0A087X0M5	115 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1B0GX30	115 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659		A8MVM7	634 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	DKK1	O94907	266 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	CST4	P01036	141 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	CELA2A	P08217	269 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	JMJD7	P0C870	316 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	SERPINF1	P36955	418 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	UCP2	P55851	309 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	CLDN6	P56747	220 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	CTXN1	P60606	82 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	EGR3	Q06889	387 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	ACBD4	Q8NC06	268 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	ST8SIA1	Q92185	356 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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