RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 CLDN6P56747 220 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 TLE1Q04724 770 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM268Q5VZI3 342 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF417Q8TAU3 575 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 COMMD4Q9H0A8 199 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 FBRSQ9HAH7 460 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 C19orf12Q9NSK7 152 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC187A0A096LP49 1063 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 DHRS7CA6NNS2 312 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 K7EPK0 472 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 RAB27BO00194 218 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 ERGP11308 486 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 KIR3DL2P43630 455 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 FHL1Q13642 323 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 WDR38Q5JTN6 314 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 THEM4Q5T1C6 240 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 Q6ZS52 159 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 MED25Q71SY5 747 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 SLC35G3Q8N808 338 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 AQP10Q96PS8 301 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 GPR87Q9BY21 358 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 OR11A1Q9GZK7 315 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 ASCL3Q9NQ33 180 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 MPDZO75970 2070 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 PLXNA2O75051 1894 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 SLC17A2O00624 439 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 CST4P01036 141 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 SLC35G6P0C7Q6 338 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 NID1P14543 1247 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 HLA-GP17693 338 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 HTR2CP28335 458 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 TACR3P29371 465 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 PRPS1P60891 318 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 HERPUD1Q15011 391 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 AARDQ4LEZ3 155 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 AWAT2Q6E213 333 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 OR2L8Q8NGY9 312 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 M1APQ8TC57 530 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 RNF128Q8TEB7 428 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM230Q96A57 120 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 FAM210BQ96KR6 192 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 SDF2Q99470 211 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 NMES1Q9C002 83 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF700Q9H0M5 742 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 ICE1Q9Y2F5 2266 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 MASP2O00187 686 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 MELTFP08582 738 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 PAX1P15863 534 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF708P17019 499 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 FUT3P21217 361 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 GLRA1P23415 457 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 GABRA3P34903 492 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 CX3CR1P49238 355 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 UCP3P55916 312 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 RAB1AP62820 205 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 FOXK1P85037 733 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 OR5I1Q13606 314 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 CST6Q15828 149 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 EIPR1Q53HC9 387 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 ALG10BQ5I7T1 473 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 PLXDC2Q6UX71 529 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 MARCH3Q86UD3 253 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 NECAP1Q8NC96 275 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 OR5R1Q8NH85 324 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 STT3BQ8TCJ2 826 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 SPACA5Q96QH8 159 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 LPAR4Q99677 370 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 MRI1Q9BV20 369 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 OR51B6Q9H340 312 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 WFDC1Q9HC57 220 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 FSCN3Q9NQT6 498 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 CKLFQ9UBR5 152 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 CYP8B1Q9UNU6 501 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 LIPGQ9Y5X9 500 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 OBSL1O75147 1896 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1W2PQU0 124 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 FAM221AA4D161 298 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 NDUFB2O95178 105 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 HLA-DQA2P01906 255 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 OR5H8P0DN80 308 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 IRF2P14316 349 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 CPMP14384 443 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 PNLIPP16233 465 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 DRD3P35462 400 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 PDGFRLQ15198 375 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 PRSS8Q16651 343 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-211ENST00000618610 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms