RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592674.1

RPRD1A-211, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1A, Length 566 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1A-211ENST00000592674 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa13.13□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 OR2V2Q96R30 315 aa13.13□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 TMED9Q9BVK6 235 aa13.13□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 CXXC4Q9H2H0 198 aa13.13□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 SAP30LQ9HAJ7 183 aa13.13□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 VCX3AQ9NNX9 186 aa13.13□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 IL19Q9UHD0 177 aa13.13□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 APCP25054 2843 aa13.12□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa13.12□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa13.12□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 GATBO75879 557 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 SERPINA3P01011 423 aa13.12□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 TNFRSF1AP19438 455 aa13.12□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 CD200P41217 278 aa13.12□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 MZT1Q08AG7 82 aa13.12□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 MAB21L1Q13394 359 aa13.12□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 CEACAM21Q3KPI0 293 aa13.12□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 Q499Y3 187 aa13.12□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 SPRNQ5BIV9 151 aa13.12□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 DMRTC1Q5HYR2 192 aa13.12□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 PHC2Q8IXK0 858 aa13.12□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa13.12□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 MS4A15Q8N5U1 240 aa13.12□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 HPSE2Q8WWQ2 592 aa13.12□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 OR5P3Q8WZ94 311 aa13.12□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 TMEM203Q969S6 136 aa13.12□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 TMEM106AQ96A25 262 aa13.12□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 ITPKCQ96DU7 683 aa13.12□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 MICU1Q9BPX6 476 aa13.12□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 RTL8AQ9BWD3 113 aa13.12□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 CHST5Q9GZS9 411 aa13.12□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 C14orf119Q9NWQ9 140 aa13.12□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 MAGEA13PA6NCF6 341 aa13.11□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 TRIM64CA6NLI5 447 aa13.11□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 SSX4O60224 188 aa13.11□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 CD2P06729 351 aa13.11□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 SMIM18P0DKX4 95 aa13.11□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 DAOP14920 347 aa13.11□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 RPS25P62851 125 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 SSX1Q16384 188 aa13.11□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 SERPINA12Q8IW75 414 aa13.11□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa13.11□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 MUL1Q969V5 352 aa13.11□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 RNF170Q96K19 258 aa13.11□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 OR14A2Q96R54 314 aa13.11□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 ROS1P08922 2347 aa13.11□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 TACC2O95359 2948 aa13.1□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 PLCE1Q9P212 2302 aa13.1□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa13.1□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa13.1□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 ZNF879B4DU55 563 aa13.1□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 CCRL2O00421 344 aa13.1□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 CDC14BO60729 498 aa13.1□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 GRPP07492 148 aa13.1□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 THBS2P35442 1172 aa13.1□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 GPM6AP51674 278 aa13.1□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 GP2P55259 537 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 TRAM1Q15629 374 aa13.1□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 UBE2V2Q15819 145 aa13.1□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa13.1□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 UTS2BQ765I0 119 aa13.1□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 PARP16Q8N5Y8 322 aa13.1□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 OR5A2Q8NGI9 324 aa13.1□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 OR5D14Q8NGL3 314 aa13.1□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 OR13C9Q8NGT0 318 aa13.1□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 NPRL2Q8WTW4 380 aa13.1□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 RDH5Q92781 318 aa13.1□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 TECTBQ96PL2 329 aa13.1□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa13.1□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 NDUFB11Q9NX14 153 aa13.1□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 TREM2Q9NZC2 230 aa13.1□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 SLC7A11Q9UPY5 501 aa13.1□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa13.09□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 A0A1W2PPK0 400 aa13.09□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 OR5B21A6NL26 309 aa13.09□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 ZNF732B4DXR9 585 aa13.09□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 LYNX1G3V0Z9 82 aa13.09□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 DSCAMO60469 2012 aa13.09□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 LYNX1P0DP58 116 aa13.09□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 ATF1P18846 271 aa13.09□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 COL8A2P25067 703 aa13.09□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 GABRA5P31644 462 aa13.09□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 CRYBB2P43320 205 aa13.09□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 GNG3P63215 75 aa13.09□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 INSL4Q14641 139 aa13.09□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 CARTPTQ16568 116 aa13.09□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 ACSM3Q53FZ2 586 aa13.09□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 WDR86Q86TI4 376 aa13.09□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 MOGAT3Q86VF5 341 aa13.09□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 ZNF525Q8N782 197 aa13.09□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 OR1M1Q8NGA1 313 aa13.09□□□□□ -0.31
RPRD1A-211ENST00000592674 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms