RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 TSSK6Q9BXA6 273 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 TOR3AQ9H497 397 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF391Q9UJN7 358 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 NKX6-3A6NJ46 265 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 H3BUX3 64 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 GASTP01350 101 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 PRDX6P30041 224 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE2E1P51965 193 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 HMGA2P52926 109 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 MXRA7P84157 204 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC01590Q5TEZ4 76 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 Q6ZTK2 550 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 MICU1Q9BPX6 476 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 DNTTIP1Q9H147 329 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 M0R1W7 72 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 OPN1MWP04001 364 aa20.93■□□□□ 0.94
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CAPNS1-211ENST00000590874 OPN1MW3P0DN78 364 aa20.93■□□□□ 0.94
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CAPNS1-211ENST00000590874 EFNB2P52799 333 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 IL5RAQ01344 420 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ACSM1Q08AH1 577 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 SAMD5Q5TGI4 173 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 NCR3LG1Q68D85 454 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 HCP5Q6MZN7 132 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 BEND2Q8NDZ0 799 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 OR52H1Q8NGJ2 320 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF133Q8WVZ7 376 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 AMELYQ99218 206 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ABHD6Q9BV23 337 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 RTL8AQ9BWD3 113 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 BRD7Q9NPI1 651 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ARMC1Q9NVT9 282 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXJ3Q9UPW0 622 aa20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ANXA2P2A6NMY6 339 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFRSF11BO00300 401 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT36O76013 467 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 SOX14O95416 240 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM107AO95990 144 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 C11orf44Q8N8P7 122 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10Z1Q8NGY1 313 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 OR6N2Q8NGY6 317 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ANGPTL6Q8NI99 470 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10A2Q9H208 303 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 SP140LQ9H930 580 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PQ09 198 aa20.91■□□□□ 0.94
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CAPNS1-211ENST00000590874 ACKR3P25106 362 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 PRDX4Q13162 271 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 LY6EQ16553 131 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 AQP11Q8NBQ7 271 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5P3Q8WZ94 311 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 RORBQ92753 470 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 AJUBAQ96IF1 538 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 SSX3Q99909 188 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 MPC1Q9Y5U8 109 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF850A8MQ14 1090 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 SIGLEC5O15389 551 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 CCNB2O95067 398 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 APOC1P02654 83 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFB7P17568 137 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 OPRL1P41146 370 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 BLVRAP53004 296 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 Q6ZPA2 131 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 CPLX4Q7Z7G2 160 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00471Q8N535 108 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 HPSE2Q8WWQ2 592 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 CFHR4Q92496 578 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 MED30Q96HR3 178 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 PGAM5Q96HS1 289 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 INTS14Q96SY0 518 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 MED20Q9H944 212 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 BAIAP2Q9UQB8 552 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF281Q9Y2X9 895 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 MAB21L2Q9Y586 359 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM210A6NLX4 147 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 PAX6P26367 422 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 CAV3P56539 151 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 KCTD8Q6ZWB6 473 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 FTMTQ8N4E7 242 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHDC1Q8N7A1 406 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2T33Q8NG76 320 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 OR51G2Q8NGK0 314 aa20.89■□□□□ 0.93
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