RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 LSM1O15116 133 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 ACOX3O15254 700 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 MLNRO43193 412 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 PPIHO43447 177 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 KRT33AO76009 404 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 VAPBO95292 243 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 GPR75O95800 540 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 AIFM1O95831 613 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 HPRP00739 348 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 ATP1B1P05026 303 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 OR4A8P0C604 315 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 HSMCR30P0CW71 290 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 OR8G3PP0DMU2 310 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 NT5EP21589 574 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 FEN1P39748 380 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 SLC1A1P43005 524 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 HTR5AP47898 357 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 HADHBP55084 474 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 RAB10P61026 200 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 SYPL1Q16563 259 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 PPP1R3AQ16821 1122 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 OR4C11Q6IEV9 310 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 NEPROQ6NW34 567 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 KCNIP4Q6PIL6 250 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 CYHR1Q6ZMK1 362 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF841Q6ZN19 808 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 CCDC80Q76M96 950 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF100Q8IYN0 542 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 SLC38A6Q8IZM9 456 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM123Q8N131 208 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 ACOT4Q8N9L9 421 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 NUP37Q8NFH4 326 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 OR5AU1Q8NGC0 362 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 OR8K1Q8NGG5 319 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 OR2V1Q8NHB1 315 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 KCNG3Q8TAE7 436 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 ACTL9Q8TC94 416 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 GPR148Q8TDV2 347 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 ABHD3Q8WU67 409 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 PIGCQ92535 297 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 ADIPOR1Q96A54 375 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 SLC25A36Q96CQ1 311 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 HAVCR1Q96D42 359 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 NEDD4LQ96PU5 975 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 OR4K3Q96R72 315 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 TBX15Q96SF7 602 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 BPIFA3Q9BQP9 254 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 CA10Q9NS85 328 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 MED11Q9P086 117 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 PIPOXQ9P0Z9 390 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 PHF11Q9UIL8 331 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 FZR1Q9UM11 496 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 HYOU1Q9Y4L1 999 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 NCKAP5O14513 1909 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 RYR2Q92736 4967 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 CADP27708 2225 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 MED12Q93074 2177 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 A0A087X0T9 212 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 OR6C70A6NIJ9 312 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 LRRC30A6NM36 301 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 SNTNA6NMZ2 147 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 H0YL77 283 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 hCG_2039718K7EN88 272 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 SAP18O00422 153 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 TSPAN2O60636 221 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 SH3BGRLO75368 114 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 NPPAP01160 153 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 IGKV3-15P01624 115 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 CLPSP04118 112 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 S100A6P06703 90 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 FAM228BP0C875 321 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 SLC35E2BP0CK96 405 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 SLC35E2P0CK97 266 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF17P17021 662 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 IGHV1-2P23083 117 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 CD1BP29016 333 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 CCT3P49368 545 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 ATP4BP51164 291 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 RAP1GDS1P52306 607 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 AP1S2P56377 157 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 NAAAQ02083 359 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 MERTKQ12866 999 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 BNIP1Q12981 228 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 LINC01620Q4KN68 170 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 CASC10Q5T4H9 136 aa3.55□□□□□ -1.84
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