RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503501.1

SENP6-212, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 2,041 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-212ENST00000503501 RBM34P42696 430 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
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SENP6-212ENST00000503501 PDZK1IP1Q13113 114 aa-0.34□□□□□ -2.46
SENP6-212ENST00000503501 OR7A5Q15622 319 aa-0.34□□□□□ -2.46
SENP6-212ENST00000503501 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa-0.34□□□□□ -2.46
SENP6-212ENST00000503501 TMEM41BQ5BJD5 291 aa-0.34□□□□□ -2.46
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SENP6-212ENST00000503501 TMEM144Q7Z5S9 345 aa-0.34□□□□□ -2.46
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SENP6-212ENST00000503501 HS3ST5Q8IZT8 346 aa-0.34□□□□□ -2.46
SENP6-212ENST00000503501 PDIK1LQ8N165 341 aa-0.34□□□□□ -2.46
SENP6-212ENST00000503501 C3orf22Q8N5N4 141 aa-0.34□□□□□ -2.46
SENP6-212ENST00000503501 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP-0.34□□□□□ -2.46
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SENP6-212ENST00000503501 THRSPQ92748 146 aa-0.34□□□□□ -2.46
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SENP6-212ENST00000503501 SLC7A11Q9UPY5 501 aa-0.34□□□□□ -2.46
SENP6-212ENST00000503501 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP-0.34□□□□□ -2.46
SENP6-212ENST00000503501 SMARCA4P51532 1647 aa-0.34□□□□□ -2.46
SENP6-212ENST00000503501 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
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SENP6-212ENST00000503501 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa-0.34□□□□□ -2.46
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SENP6-212ENST00000503501 SPZ1Q9BXG8 430 aa-0.35□□□□□ -2.46
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