RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490800.1

CLDN1-202, Transcript of claudin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLDN1, Length 432 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN1-202ENST00000490800 TSC22D3Q99576 134 aa6.51□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa6.51□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 REG4Q9BYZ8 158 aa6.51□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 BARHL1Q9BZE3 327 aa6.51□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 COMMD4Q9H0A8 199 aa6.51□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 MOB1AQ9H8S9 216 aa6.51□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 NOX3Q9HBY0 568 aa6.51□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 NOX4Q9NPH5 578 aa6.51□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 SLC17A5Q9NRA2 495 aa6.51□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.51□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 NPAP1Q9NZP6 1156 aa6.51□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 A0A1B0GTI1 187 aa6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa6.5□□□□□ -1.37
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CLDN1-202ENST00000490800 C5orf63A6NC05 138 aa6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 E7EQL1 145 aa6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 F5H5K5 113 aa6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 H3BSH0 61 aa6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 M0R135 149 aa6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 P2RY10O00398 339 aa6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 CLPXO76031 633 aa6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 IGHV4-39P01824 125 aa6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 TTRP02766 147 aa6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 ISG15P05161 165 aa6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 ACSM4P0C7M7 580 aa6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 CD79AP11912 226 aa6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 FPR2P25090 351 aa6.5□□□□□ -1.37
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CLDN1-202ENST00000490800 HTR5AP47898 357 aa6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 SOX2P48431 317 aa6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 MTNR1BP49286 362 aa6.5□□□□□ -1.37
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CLDN1-202ENST00000490800 GALK2Q01415 458 aa6.5□□□□□ -1.37
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CLDN1-202ENST00000490800 HGFACQ04756 655 aa6.5□□□□□ -1.37
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CLDN1-202ENST00000490800 TBRG1Q3YBR2 411 aa6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 Q499Y3 187 aa6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 TMEM244Q5VVB8 128 aa6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 TMEM53Q6P2H8 277 aa6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 FAM57BQ71RH2 274 aa6.5□□□□□ -1.37
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CLDN1-202ENST00000490800 TBC1D15Q8TC07 691 aa6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 GPR148Q8TDV2 347 aa6.5□□□□□ -1.37
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CLDN1-202ENST00000490800 SLC25A46Q96AG3 418 aa6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 ORAI1Q96D31 301 aa6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 ZNF799Q96GE5 643 aa6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 BOD1Q96IK1 185 aa6.5□□□□□ -1.37
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CLDN1-202ENST00000490800 ZNF319Q9P2F9 582 aa6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 ATPIF1Q9UII2 106 aa6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 SLC25A15Q9Y619 301 aa6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 ZANQ9Y493 2812 aa6.5□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.49□□□□□ -1.37
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CLDN1-202ENST00000490800 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.49□□□□□ -1.37
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CLDN1-202ENST00000490800 SMIM30A4D0T7 59 aa6.49□□□□□ -1.37
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CLDN1-202ENST00000490800 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.49□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 KIR3DS1Q14943 382 aa6.49□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 ZNF404Q494X3 552 aa6.49□□□□□ -1.37
CLDN1-202ENST00000490800 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.49□□□□□ -1.37
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