RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 AIREO43918 545 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 IGLV3-1P01715 115 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 ADH4P08319 380 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 CSF3P09919 207 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 FAHP16930 419 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 LOXP28300 417 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 ALDH3B1P43353 468 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 KCNJ8Q15842 424 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 FAM189A2Q15884 450 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 HFEQ30201 348 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 GLT8D1Q68CQ7 371 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 XAF1Q6GPH4 301 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 Q6ZSR3 168 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 TPRA1Q86W33 373 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 CROCCP3Q8IVE0 287 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 CDH26Q8IXH8 852 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 RDH10Q8IZV5 341 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF671Q8TAW3 534 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 NEUROG1Q92886 237 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 TIMD4Q96H15 378 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 LYZL4Q96KX0 146 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 PGLYRP3Q96LB9 341 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 KCTD7Q96MP8 289 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 OR14A2Q96R54 314 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 CACNG6Q9BXT2 260 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 DLL4Q9NR61 685 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 SNTG1Q9NSN8 517 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF319Q9P2F9 582 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 COL12A1Q99715 3063 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 CCDC160A6NGH7 325 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 A6NLC8 198 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 H3BUI4 141 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 GABRPO00591 440 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM127O75204 238 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 LALBAP00709 142 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 CD55P08174 381 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 DANCRP0C864 163 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 NAT2P11245 290 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 ATF1P18846 271 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 SRMP19623 302 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 FSTP19883 344 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 CALRP27797 417 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 BDKRB2P30411 391 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 MMP15P51511 669 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 BMXP51813 675 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 MTCP1P56278 107 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 DSCR9P59020 149 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 GPR176Q14439 515 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 ALKBH6Q3KRA9 238 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 MKXQ8IYA7 352 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 OR1M1Q8NGA1 313 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 PPP1R14AQ96A00 147 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 BCL7BQ9BQE9 202 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 FAM192AQ9GZU8 254 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 RHOFQ9HBH0 211 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 MSL2Q9HCI7 577 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 GLS2Q9UI32 602 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 PTPN13Q12923 2485 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 LRRK2Q5S007 2527 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 LRP5LA4QPB2 252 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 H3BSH0 61 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 GPX5O75715 221 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 ALDOBP05062 364 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 HEXAP06865 529 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 CD200P41217 278 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 EFNA4P52798 201 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 GP2P55259 537 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 RPS25P62851 125 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 CEP78Q5JTW2 689 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 KRT74Q7RTS7 529 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 SATL1Q86VE3 508 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 LRP11Q86VZ4 500 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 Q8IYB0 196 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 OR13F1Q8NGS4 319 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 OR13C9Q8NGT0 318 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 RAB2BQ8WUD1 216 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 OR5P3Q8WZ94 311 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 RDH5Q92781 318 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 SORCS2Q96PQ0 1159 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 DERL3Q96Q80 235 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-210ENST00000486889 MRI1Q9BV20 369 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms