RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482582.5

TRAIP-208, Transcript of TRAF interacting protein, human

TSL 5

Gene TRAIP, Length 820 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAIP-208	ENST00000482582	ORAI1	Q96D31	301 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	GSX2	Q9BZM3	304 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	GMDS	O60547	372 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	CD1A	P06126	327 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	CD55	P08174	381 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	SMIM18	P0DKX4	95 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	CPE	P16870	476 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	COL8A2	P25067	703 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	SOX2	P48431	317 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	EFNA4	P52798	201 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	ATP5J2	P56134	94 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	INSL4	Q14641	139 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	SSX1	Q16384	188 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	WDR86	Q86TI4	376 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	PHC2	Q8IXK0	858 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	ITPKC	Q96DU7	683 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	OR2V2	Q96R30	315 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	GPR173	Q9NS66	373 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	EDAR	Q9UNE0	448 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	CACNG2	Q9Y698	323 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	JMJD1C	Q15652	2540 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582		A0A087WXM4	84 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	NRAS	P01111	189 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	THBS2	P35442	1172 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	GNAL	P38405	381 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	PMEL	P40967	661 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	GPR50	Q13585	617 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	MPPED2	Q15777	294 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	UBE2V2	Q15819	145 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	NEDD8	Q15843	81 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	CEP78	Q5JTW2	689 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	FAM209A	Q5JX71	171 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	MOB3C	Q70IA8	216 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	RNF144B	Q7Z419	303 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	GPR148	Q8TDV2	347 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	UFD1	Q92890	307 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	YIPF5	Q969M3	257 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	ITFG2	Q969R8	447 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	TMEM203	Q969S6	136 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	DIRC2	Q96SL1	478 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	TMED9	Q9BVK6	235 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	SLC22A4	Q9H015	551 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	TREM2	Q9NZC2	230 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	IL19	Q9UHD0	177 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	DHDH	Q9UQ10	334 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		9.97	□□□□□ -0.81
TRAIP-208	ENST00000482582	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		9.96	□□□□□ -0.82
TRAIP-208	ENST00000482582	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		9.96	□□□□□ -0.82
TRAIP-208	ENST00000482582		A0A1W2PPK0	400 aa		9.96	□□□□□ -0.82
TRAIP-208	ENST00000482582	PIN1P1	O15428	100 aa		9.96	□□□□□ -0.82
TRAIP-208	ENST00000482582	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
TRAIP-208	ENST00000482582	SSX4	O60224	188 aa		9.96	□□□□□ -0.82
TRAIP-208	ENST00000482582	CDC14B	O60729	498 aa		9.96	□□□□□ -0.82
TRAIP-208	ENST00000482582	DAO	P14920	347 aa		9.96	□□□□□ -0.82
TRAIP-208	ENST00000482582	ZNF12	P17014	697 aa		9.96	□□□□□ -0.82

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