RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462743.1

HPS1-206, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene HPS1, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-206ENST00000462743 LPAR3Q9UBY5 353 aa10.14□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 SLC22A13Q9Y226 551 aa10.14□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 MYRFQ9Y2G1 1151 aa10.14□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 PPIAL4AQ9Y536 164 aa10.14□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 TRAV20A0A0B4J274 112 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 IRGMA1A4Y4 181 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 ZNF850A8MQ14 1090 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 LGALS8O00214 317 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 NDUFA2O43678 99 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 PLPP2O43688 288 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 RPP14O95059 124 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 PCMT1P22061 227 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 DCKP27707 260 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 CAPGP40121 348 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 OR12D2P58182 307 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 ZNF154Q13106 437 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 CEACAM21Q3KPI0 293 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 ZNF404Q494X3 552 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 FAM220AQ7Z4H9 259 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 WDR86Q86TI4 376 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 PRSS35Q8N3Z0 413 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 OR52I1Q8NGK6 324 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 OR10Z1Q8NGY1 313 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 OR2G2Q8NGZ5 317 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 CYGBQ8WWM9 190 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 TFAP2CQ92754 450 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 TMEM186Q96B77 213 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 C10orf35Q96D05 121 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 RTL8AQ9BWD3 113 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 VCXQ9H320 206 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 NARFLQ9H6Q4 476 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 TRIM36Q9NQ86 728 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 UFSP2Q9NUQ7 469 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 ERVK13-1Q9NX77 482 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 MIOXQ9UGB7 285 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 ENPP5Q9UJA9 477 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa10.13□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 ISPDA4D126 451 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 ERICH4A6NGS2 130 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 OR5B21A6NL26 309 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 A8MXK9 166 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 FOXH1O75593 365 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 CLIC3O95833 236 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 ISG15P05161 165 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 GRPP07492 148 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 RPSAP08865 295 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 GATA3P23771 443 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 PSMB10P40306 273 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 ACTA2P62736 377 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 ACTG2P63267 376 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 RIPK1Q13546 671 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 TP53I3Q53FA7 332 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 WDR38Q5JTN6 314 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 TMEM244Q5VVB8 128 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 WDR82Q6UXN9 313 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 THAP5Q7Z6K1 395 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 LHFPL3Q86UP9 236 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 GLCCI1Q86VQ1 547 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 GCSAMQ8N6F7 178 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 HPSE2Q8WWQ2 592 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 RNF170Q96K19 258 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 TMEM246Q9BRR3 403 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 C1orf123Q9NWV4 160 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 GNG8Q9UK08 70 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 PCDHB10Q9UN67 800 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 PIGLQ9Y2B2 252 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 NF1P21359 2839 aa10.12□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa10.11□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 CEACAM18A8MTB9 384 aa10.11□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 SRRM5B3KS81 715 aa10.11□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 P2RY10O00398 339 aa10.11□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 NRASP01111 189 aa10.11□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 LIMS3P0CW19 117 aa10.11□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 LIMS4P0CW20 117 aa10.11□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 ZNF12P17014 697 aa10.11□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 THBS2P35442 1172 aa10.11□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 RBMXP38159 391 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 KIR3DL2P43630 455 aa10.11□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 GNG3P63215 75 aa10.11□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 KCNJ8Q15842 424 aa10.11□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 CR1LQ2VPA4 569 aa10.11□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 CHRFAM7AQ494W8 412 aa10.11□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 FAM201AQ5SY85 155 aa10.11□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 CLVS2Q5SYC1 327 aa10.11□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 FAM120AOSQ5T036 256 aa10.11□□□□□ -0.79
HPS1-206ENST00000462743 TEX36Q5VZQ5 186 aa10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms