RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 PRSS47A8MTI9 375 aa5.21□□□□□ -1.58
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C6orf48-208ENST00000395788 HLA-DMAP28067 261 aa5.2□□□□□ -1.58
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C6orf48-208ENST00000395788 AP3S2P59780 193 aa5.2□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 ZP1P60852 638 aa5.2□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa5.2□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP5.2□□□□□ -1.583e-13■■■■□ 25.3
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C6orf48-208ENST00000395788 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 KRTCAP3Q53RY4 240 aa5.2□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 RTL6Q6ICC9 239 aa5.2□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM53Q6P2H8 277 aa5.2□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 Q6ZT83 130 aa5.2□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 SEM1Q6ZVN7 128 aa5.2□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 RNF144BQ7Z419 303 aa5.2□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 P4HA3Q7Z4N8 544 aa5.2□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 IZUMO1Q8IYV9 350 aa5.2□□□□□ -1.58
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