RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371219.2

RBM38-204, Transcript of RNA binding motif protein 38, human

TSL 2 BASIC

Gene RBM38, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM38-204	ENST00000371219	FAH	P16930	419 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	PRSS12	P56730	875 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	PRDX4	Q13162	271 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	GPR50	Q13585	617 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	RIN1	Q13671	783 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	SPHAR	Q15513	63 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	SVOP	Q8N4V2	548 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	GCM1	Q9NP62	436 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	HIVEP1	P15822	2718 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	F8	P00451	2351 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	LRRC30	A6NM36	301 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	CLDN25	C9JDP6	229 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219		E9PI62	339 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219		F5H5P2	479 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	PLPP2	O43688	288 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	SERPINA3	P01011	423 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	NRAS	P01111	189 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	MT-ND2	P03891	347 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	HLA-DPB1	P04440	258 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	GNG3	P63215	75 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	MAB21L1	Q13394	359 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	UTS2B	Q765I0	119 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	GPR148	Q8TDV2	347 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	TIMD4	Q96H15	378 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219		Q96MF0	132 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	SOX7	Q9BT81	388 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	MED13L	Q71F56	2210 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	ZAN	Q9Y493	2812 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	ACAN	P16112	2415 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	VWC2L	B2RUY7	222 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	LY6H	O94772	140 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	ALX3	O95076	343 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	CD2	P06729	351 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	ODF4	Q2M2E3	257 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	XAF1	Q6GPH4	301 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	PIGC	Q92535	297 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	FCGR1B	Q92637	280 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	YIPF5	Q969M3	257 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	NEK6	Q9HC98	313 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	LRP5L	A4QPB2	252 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219		H0YL77	283 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	HAX1	O00165	279 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	TNFAIP8	O95379	198 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	LALBA	P00709	142 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	ZNF20	P17024	532 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	CPT2	P23786	658 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	CFHR2	P36980	270 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	NR4A2	P43354	598 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	SGCD	Q92629	289 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	SPSB1	Q96BD6	273 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	DHDH	Q9UQ10	334 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RBM38-204	ENST00000371219	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RBM38-204	ENST00000371219	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RBM38-204	ENST00000371219	IRF2	P14316	349 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RBM38-204	ENST00000371219	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
RBM38-204	ENST00000371219	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
RBM38-204	ENST00000371219	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
RBM38-204	ENST00000371219	ZNF154	Q13106	437 aa		12.45	□□□□□ -0.42

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