RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028769.12

Ptpra-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptpra, Length 3,227 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpra-201ENSMUST00000028769 GastP48757 101 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Tmem14aP56983 99 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Lhfpl5Q4KL25 219 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Pafah1b3Q61205 232 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr1168Q7TR25 312 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Elfn1Q8C8T7 828 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cbr3Q8K354 277 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Chrdl2Q8VEA6 426 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr800Q8VFH7 311 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr1497Q8VG11 314 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Zfp61Q923D1 555 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 HypmQ9CR04 117 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 NmbQ9CR53 121 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Il36bQ9D6Z6 183 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Twsg1Q9EP52 222 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Nkain4Q9JMG4 208 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Adh4Q9QYY9 377 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Prr23a2D3YWX5 253 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Vmn2r107E9PZJ7 861 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Zfp988F6VKC7 633 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Il1r1P13504 576 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Thsd4Q3UTY6 1018 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr988Q7TRA1 309 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Znf2Q8BIQ3 427 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Nob1Q8BW10 403 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Lrfn5Q8BXA0 719 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Hbq1aQ8BYM1 145 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Dzank1Q8C008 778 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr919Q8VF78 315 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr522Q8VGL1 312 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Q9CYS6 286 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Foxo1Q9R1E0 652 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Arhgap21Q6DFV3 1944 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 A0A1L1SV24 88 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr239A0PK55 315 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm21976J3QNN2 249 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr55K7N6Q1 315 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Sp100O35892 482 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Fgf14P70379 247 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Lsm11Q8BUV6 361 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 GcaQ8VC88 220 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Rab7bQ8VEA8 199 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 St3gal6Q8VIB3 329 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Arfgap3Q9D8S3 523 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Vmn1r172Q9EPS4 313 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 FcrlsQ9EQY5 509 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 GnmtQ9QXF8 293 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Slc39a1Q9QZ03 324 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm26992S4R1A3 76 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Wnk2Q3UH66 2149 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Pax4P32115 349 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Plpp5Q3UMZ3 260 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Krt33bQ61897 404 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr1126Q7TR49 314 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ube3dQ8BX13 368 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gpat4Q8K2C8 456 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Syngr3Q8R191 229 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Galnt11Q921L8 608 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Asf1bQ9DAP7 202 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Bcl3Q9Z2F6 448 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Wdr90Q6ZPG2 1874 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cabin1G3X8Q1 2187 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 HelzQ6DFV5 1964 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Zfp747Q8BHM7 422 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Defb6Q91VD6 63 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Suv39h2Q9EQQ0 477 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Lancl2Q9JJK2 450 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Sema7aQ9QUR8 664 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Insl6Q9QY05 191 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Urb1Q571H0 2274 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr18Q0VAX9 331 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Entpd8Q8K0L2 497 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr995Q8VF74 315 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 DapQ91XC8 102 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cryba2Q9JJV1 197 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 2010106E10RikA2ANY3 279 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Rnaset2aC0HKG5 259 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Rnaset2bC0HKG6 259 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 P01800 113 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Klk1b11P15946 261 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Elavl1P70372 326 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Agbl5Q09M02 886 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Zfp235Q499D5 702 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr5Q60889 312 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cfap161Q6P8Y0 303 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Abhd6Q8R2Y0 336 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr341Q8VGK9 313 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Spef1Q99JL1 234 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gdpd3Q99LY2 330 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ms4a8Q99N10 290 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Slc22a5Q9Z0E8 557 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr568E9Q554 313 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 EdaO54693 391 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 AF067061O70616 171 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Hsd17b8P50171 259 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 S100a1P56565 94 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ear2P97425 156 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Atf4Q06507 349 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Fam98bQ80VD1 429 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Pla2g3Q8BZT7 504 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.4 ms