RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 CROCCP3Q8IVE0 287 aa20.63■□□□□ 0.89
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CAPNS1-216ENST00000628306 NUP37Q8NFH4 326 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-216ENST00000628306 MCFD2Q8NI22 146 aa20.63■□□□□ 0.89
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CAPNS1-216ENST00000628306 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-216ENST00000628306 POLR1DQ9Y2S0 133 aa20.63■□□□□ 0.89
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CAPNS1-216ENST00000628306 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa20.58■□□□□ 0.88
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CAPNS1-216ENST00000628306 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
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CAPNS1-216ENST00000628306 ELFN2Q5R3F8 820 aa20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 DPPA2Q7Z7J5 298 aa20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 ELMOD2Q8IZ81 293 aa20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 DERL3Q96Q80 235 aa20.58■□□□□ 0.88
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