RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 SFXN4Q6P4A7 337 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 PCSK4Q6UW60 755 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 CD300LDQ6UXZ3 194 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 RIMKLAQ8IXN7 391 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 SLC38A6Q8IZM9 456 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 TOMM40LQ969M1 308 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 GPR84Q9NQS5 396 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 NUDT15Q9NV35 164 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 NDUFAF4Q9P032 175 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 TRAV20A0A0B4J274 112 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 YIF1AO95070 293 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 RAB3DO95716 219 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 CDK1P06493 297 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 C1QTNF9P0C862 333 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 FUT3P21217 361 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 KITLGP21583 273 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 UCP2P55851 309 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 PDCD1Q15116 288 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 SLC25A30Q5SVS4 291 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 PLPP7Q8NBV4 271 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 OTOSQ8NHW6 89 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 ABHD3Q8WU67 409 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 DEDD2Q8WXF8 326 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 FUZQ9BT04 418 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 SCGB1D2O95969 90 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 GASTP01350 101 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 OPN1MWP04001 364 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 CSN2P05814 226 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 FBP1P09467 338 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 OPN1MW2P0DN77 364 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 OPN1MW3P0DN78 364 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 EFNA4P52798 201 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 SPOCK1Q08629 439 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 PRSS41Q7RTY9 318 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 FAM90A1Q86YD7 464 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 C20orf196Q8IYI0 205 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 ZBTB34Q8NCN2 500 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 GGHQ92820 318 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM203Q969S6 136 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM106AQ96A25 262 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 OR8B4Q96RC9 309 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 DHRS7CA6NNS2 312 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 SULT1C2O00338 296 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 SHOXO15266 292 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 PTNP21246 168 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 APEX1P27695 318 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 PPT1P50897 306 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 FXYD6P3P58550 94 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 RAP2BP61225 183 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 PLA2G7Q13093 441 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 PRDX4Q13162 271 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 MPV17LQ2QL34 196 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 CLIP4Q8N3C7 705 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 IQCF1Q8N6M8 205 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 GDPD1Q8N9F7 314 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 AKR7LQ8NHP1 331 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 GNB4Q9HAV0 340 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 GPR173Q9NS66 373 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 LOC105371242A0A075B767 164 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 LEUTXA8MZ59 168 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 GABRPO00591 440 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 PF4P02776 101 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 IFNA4P05014 189 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 ADRA2AP08913 450 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 S100A10P60903 97 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 LTBQ06643 244 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 MESP2Q0VG99 397 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 NADK2Q4G0N4 442 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 SNX29P2Q8IUI4 249 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 BHLHE23Q8NDY6 225 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 OR4X2Q8NGF9 303 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 RPS4Y2Q8TD47 263 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 HGDQ93099 445 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 ADIPOR1Q96A54 375 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 MARVELD3Q96A59 401 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 POM121L2Q96KW2 1035 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD4-212ENST00000591126 TUBB1Q9H4B7 451 aa5.55□□□□□ -1.52
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