RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520166.5

TSNARE1-205, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,742 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-205ENST00000520166 DCHS2Q6V1P9 2916 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF850A8MQ14 1090 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 SHISA9B4DS77 424 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 GMDSO60547 372 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 ARL6IP5O75915 188 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 RAF1P04049 648 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 CD2P06729 351 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 MAP2K3P46734 347 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 MTNR1BP49286 362 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF529Q6P280 563 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 CRIP3Q6Q6R5 217 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 PAMR1Q6UXH9 720 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 HAVCR1Q96D42 359 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 SYT3Q9BQG1 590 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 MYL9P24844 172 aa14.56□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 KIR2DL3P43628 341 aa14.56□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 OR1M1Q8NGA1 313 aa14.56□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 PIGTQ969N2 578 aa14.56□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 PIK3IP1Q96FE7 263 aa14.56□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 DACH2Q96NX9 599 aa14.56□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 BCL2L14Q9BZR8 327 aa14.56□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa14.56□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 DUSP13Q9UII6 198 aa14.56□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 ATP23Q9Y6H3 246 aa14.56□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 H0YL77 283 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 IL1AP01583 271 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 IGFBP2P18065 325 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 RAB3BP20337 219 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 CA6P23280 308 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 CLDN12P56749 244 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 HES5Q5TA89 166 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 TMEM42Q69YG0 159 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 MOB3CQ70IA8 216 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 OR5D14Q8NGL3 314 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 UBASH3BQ8TF42 649 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 PHYHIPQ92561 330 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 SLC25A46Q96AG3 418 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 TSC22D3Q99576 134 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 LRRK2Q5S007 2527 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 ABCA4P78363 2273 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 A1L4Q6 167 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 E7EQL1 145 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 C3orf80F5H4A9 247 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 ATF1P18846 271 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 FSTP19883 344 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 GLRXP35754 106 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 Q6ZR03 302 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 RFT1Q96AA3 541 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 CHST5Q9GZS9 411 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 KCNK15Q9H427 330 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 MSL2Q9HCI7 577 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 CA10Q9NS85 328 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF391Q9UJN7 358 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 FOXJ3Q9UPW0 622 aa14.55□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa14.54□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 A0A1W2PPR1 153 aa14.54□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 CLDN1O95832 211 aa14.54□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 NRASP01111 189 aa14.54□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 RAC2P15153 192 aa14.54□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 PAX7P23759 505 aa14.54□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 PLA2G7Q13093 441 aa14.54□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 PRDX4Q13162 271 aa14.54□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF718Q3SXZ3 478 aa14.54□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa14.54□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 LYPD6Q86Y78 171 aa14.54□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 NGBQ9NPG2 151 aa14.54□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 DAPK2Q9UIK4 370 aa14.54□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa14.53□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 J3QW42 95 aa14.53□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 SULT1B1O43704 296 aa14.53□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 PAHP00439 452 aa14.53□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 CD3EP07766 207 aa14.53□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF250P15622 560 aa14.53□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 SELEP16581 610 aa14.53□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF12P17014 697 aa14.53□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 RAB3AP20336 220 aa14.53□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 CFL1P23528 166 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 THBS2P35442 1172 aa14.53□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 CLVS2Q5SYC1 327 aa14.53□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 IDNKQ5T6J7 187 aa14.53□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 HPSE2Q8WWQ2 592 aa14.53□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 CKLFQ9UBR5 152 aa14.53□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 POU2F3Q9UKI9 436 aa14.53□□□□□ -0.08
TSNARE1-205ENST00000520166 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms