RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 TMED9Q9BVK6 235 aa10.04□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 PLEKHA1Q9HB21 404 aa10.04□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 FAIMQ9NVQ4 179 aa10.04□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 CKLFQ9UBR5 152 aa10.04□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 ENPP5Q9UJA9 477 aa10.04□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 CD300LBA8K4G0 201 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 NOL3O60936 208 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 CST4P01036 141 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 UCHL1P09936 223 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 ZNF20P17024 532 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 FSTP19883 344 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 TGFBR2P37173 567 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 CRYBB2P43320 205 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 TMBIM6P55061 237 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 MZT1Q08AG7 82 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 DOC2BQ14184 412 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 EFNB3Q15768 340 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 GFOD2Q3B7J2 385 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 SPERTQ8NA61 448 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 OR2AE1Q8NHA4 323 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 TMEM106AQ96A25 262 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 DIRC2Q96SL1 478 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 FUNDC2Q9BWH2 189 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 SLITRK2Q9H156 845 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 CXXC4Q9H2H0 198 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 LIME1Q9H400 295 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 FOXJ3Q9UPW0 622 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 MPC1Q9Y5U8 109 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-211ENST00000488243 VPS13CQ709C8 3753 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 A0A1B0GWJ7 208 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 MEGF11A6BM72 1044 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 B9A039 149 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 GABRPO00591 440 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 HS3ST1O14792 307 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 SIAH2O43255 324 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 AIREO43918 545 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 GMDSO60547 372 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 GABARAPO95166 117 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 BMP4P12644 408 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 SERPINF1P36955 418 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 GNALP38405 381 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 FABP6P51161 128 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 PSMD7P51665 324 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 RPS25P62851 125 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 SPOCK1Q08629 439 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 PSG7Q13046 419 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 ADIPOQQ15848 244 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 ODF4Q2M2E3 257 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 CLVS2Q5SYC1 327 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 TMEM42Q69YG0 159 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 Q71RC1 249 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 CEACAM19Q7Z692 300 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 CDH26Q8IXH8 852 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 RDH10Q8IZV5 341 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 FBXL14Q8N1E6 418 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 KBTBD8Q8NFY9 601 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 OR8G5Q8NG78 346 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 RAB2BQ8WUD1 216 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 TMEM203Q969S6 136 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 FBXW5Q969U6 566 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 DERL3Q96Q80 235 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 PLK3Q9H4B4 646 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 PIGLQ9Y2B2 252 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 RTTNQ86VV8 2226 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 PLSCR5A0PG75 271 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 C5orf63A6NC05 138 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 E7EQL1 145 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 TMEM127O75204 238 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 OR4A8P0C604 315 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 PPP3R1P63098 170 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 FABP5Q01469 135 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 HSD17B12Q53GQ0 312 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 FAM209AQ5JX71 171 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 SPATA46Q5T0L3 261 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 AGAP6Q5VW22 663 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 TMEM91Q6ZNR0 172 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 TPRA1Q86W33 373 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 ZNF611Q8N823 705 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 DNAAF1Q8NEP3 725 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 OR56B2PQ8NGI1 322 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 OR51A4Q8NGJ6 313 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-211ENST00000488243 OR13G1Q8NGZ3 307 aa10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.1 ms