RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410856.1

RNU2-38P-201, Transcript of RNA, U2 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU2-38P, Length 79 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU2-38P-201ENST00000410856 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 FMO2Q99518 471 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 DCAF16Q9NXF7 216 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 BABAM2Q9NXR7 383 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 ANGPT4Q9Y264 503 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 NCKAP5O14513 1909 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 IGSF10Q6WRI0 2623 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 TP53I11O14683 189 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 KLHL41O60662 606 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 RAD1O60671 282 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 TGM6O95932 706 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 OPN1SWP03999 348 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 PTHLHP12272 177 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 IL32P24001 234 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 CD70P32970 193 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCT3P49368 545 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 C1orf185Q5T7R7 199 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 NPSR1Q6W5P4 371 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM71AQ8IYT1 594 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 APH1BQ8WW43 257 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 SENP8Q96LD8 212 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 Q96MT0 163 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 RDH14Q9HBH5 336 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 NAGKQ9UJ70 344 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 FADS3Q9Y5Q0 445 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLIT2O94813 1529 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 NCOR2Q9Y618 2525 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 TECTAO75443 2155 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 ATP10AO60312 1499 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 CACNA1EQ15878 2313 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 A0A0G2JQZ4 141 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 TMEM72A0PK05 275 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 C17orf98A8MV24 154 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRGV3P03979 118 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 IL10P22301 178 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 NUDT2P50583 147 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 NDUFA8P51970 172 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 ART3Q13508 389 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF266Q14584 549 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 HHATQ5VTY9 493 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 MLIPQ5VWP3 458 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 LRRC66Q68CR7 880 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 NOXRED1Q6NXP6 359 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 MS4A15Q8N5U1 240 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF738Q8NE65 137 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR4F6Q8NGB9 312 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR4X1Q8NH49 305 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC7A13Q8TCU3 470 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 RNF133Q8WVZ7 376 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 PPP1R36Q96LQ0 422 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 TIMM21Q9BVV7 248 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 CA10Q9NS85 328 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 C22orf24Q9Y442 160 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 KIF16BQ96L93 1317 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU2-38P-201ENST00000410856 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa-0.72□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 FHOD3Q2V2M9 1422 aa-0.72□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 A0A0J9YYE9 177 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM170AA1A519 330 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 LYRM9A8MSI8 78 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 SMPD2O60906 423 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRBC1P01850 177 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 DBTP11182 482 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 CRABP2P29373 138 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 NSG1P42857 185 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 GABRA4P48169 554 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 TUFMP49411 452 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 KCNJ2P63252 427 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRDNQ13061 729 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 MAPRE2Q15555 327 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 TNXAQ16473 311 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 USH1GQ495M9 461 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 LGALS9CQ6DKI2 356 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM184AQ8NB25 1140 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 MFSD8Q8NHS3 518 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 TCEANC2Q96MN5 208 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 EMC6Q9BV81 110 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 NINJ2Q9NZG7 142 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 ADAM28Q9UKQ2 775 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU2-38P-201ENST00000410856 A0A1W2PPV9 198 aa-0.74□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms