RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055506.8

Gtf3c1-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c1, Length 6,961 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Dock11A2AF47 2073 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1555-ps1A0A140LHT7 321 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rhox2cA2AWL9 191 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rnf148G3X9R7 316 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tcstv1O70619 171 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rab22aP35285 194 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Sirt6P59941 334 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1371Q7TQT7 311 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 ItpkcQ7TS72 678 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Znf689Q8BKK5 500 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Stbd1Q8C7E7 338 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1431Q8VF59 312 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1044Q8VGR9 314 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1054Q8VGS7 312 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 St3gal6Q8VIB3 329 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ogfod3Q9D136 315 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Hsd17b6Q9R092 317 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ccr9Q9WUT7 369 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm9376G3UW68 176 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gstm6O35660 218 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ring1O35730 406 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cd1d1P11609 336 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cd1d2P11610 336 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rpl29P47915 160 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Hist1h3aP68433 136 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Fam171bQ14CH0 825 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ttyh2Q3TH73 532 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr884Q7TRE1 309 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mospd3Q8BGG6 235 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Znf750Q8BH05 703 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 RnasekQ8K3C0 98 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Golt1aQ9DCQ3 133 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mamdc4A2AJA7 1228 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 AI182371A2AS37 356 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm5286E0CXI6 357 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Vmn1r20K7N778 303 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tcf21O35437 179 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gpr27O54897 379 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Acp2P24638 423 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 F13bQ07968 669 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Selenbp2Q63836 472 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr658Q8VGV5 323 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 LipfQ9CPP7 395 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 ApelaP0DMC4 54 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Nid1P10493 1245 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Htr5aP30966 357 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Chrna7P49582 502 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 MamstrQ0ZCJ7 421 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cyp1b1Q64429 543 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 St8sia3Q64689 380 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Fbxo27Q6DIA9 280 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 CenpoQ8K015 298 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 DohhQ99LN9 302 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Coq5Q9CXI0 327 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Snapc3Q9D2C9 407 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Stard5Q9EPQ7 213 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Slc2a8Q9JIF3 477 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr465-ps1A0A0U1RPZ4 315 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm1110F6Y113 635 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tesk1O70146 627 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Sp1O89090 784 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cd79aP11911 220 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Wdr34Q5U4F6 535 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Slain1Q68FF7 579 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cd3eapQ76KJ5 399 aa10.19□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Trav5-4A0A075B652 114 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Sdc1P18828 311 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tnfrsf1aP25118 454 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tmem184aQ3UFJ6 425 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cdadc1Q8BMD5 523 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 ShfQ8CG80 238 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr849Q8VFF6 312 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1301Q8VGE7 312 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mfsd4b2Q9D8I5 366 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Dll4Q9JI71 686 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Scn4aQ9ER60 1841 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr911-ps1A0A140T8K0 311 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm572B1ARY8 399 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cnih1O35372 144 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Klk1b16P04071 261 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Bpifa2P07743 235 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rab18P35293 206 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Folr1P35846 255 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 FaslgP41047 279 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Dlx4P70436 240 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cd84Q18PI6 329 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1340Q3KPC7 315 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Znf48Q3US17 591 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 PiglQ5SX19 252 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 SrmQ64674 302 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr193Q7TS43 309 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Znf770Q8BIQ8 705 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Atxn7l2Q8C8K6 696 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gas2l1Q8JZP9 678 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1457Q8VFK3 317 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pbp2Q8VIN1 187 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Slc35b3Q922Q5 369 aa10.18□□□□□ -0.78
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ube2dnl2A2AFH2 155 aa10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 51.7 ms