RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 HexaP29416 528 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Foxr2Q3UM89 302 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kng2Q6S9I3 644 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cdhr3Q8BL00 831 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q8BN57 294 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tceal5Q8CCT4 200 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Parp11Q8CFF0 331 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gpr1Q8K087 353 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Neil1Q8K4Q6 389 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tceal3Q8R0A5 200 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r193Q8R258 319 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 B3gnt8Q8R3I9 389 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp959Q91VM8 539 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dcp1aQ91YD3 602 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Egln2Q91YE2 419 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 1700034E13RikQ9D2T6 108 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ceacam20Q9D2Z1 577 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tceal6Q9DB24 200 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Syt6Q9R0N8 511 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pfdn5Q9WU28 154 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kdf1A2A9F4 397 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r129E9QA94 307 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm8720K9J7F4 307 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp977L7N2E7 438 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fabp9O08716 132 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rab2aP53994 212 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nup43P59235 380 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nhlrc4Q3UP44 136 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rnf223Q3UV31 285 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc35f2Q7TML3 375 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1087Q7TR63 313 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pck2Q8BH04 640 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Klk14Q8CGR5 250 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r208Q8R275 308 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pla2g16Q8R3U1 162 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr539Q8VGL9 319 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cst14Q8VII3 130 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mat1aQ91X83 396 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Atg5Q99J83 275 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 HrgQ9ESB3 525 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mocs2Q9Z223 189 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MpoP11247 718 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rab5cP35278 216 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nkx2-2P42586 273 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nrg2P56974 756 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 NfybP63139 207 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 F13bQ07968 669 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Foxred1Q3TQB2 487 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 C1ql4Q4ZJM9 238 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 GcdhQ60759 438 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vamp1Q62442 118 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp663Q6NXM6 656 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rcor3Q6PGA0 451 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1115Q7TR53 326 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Plekhm1Q7TSI1 1074 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Stk35Q80ZW0 539 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lpar6Q8BMC0 344 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 RybpQ8CCI5 228 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 LiphQ8CIV3 451 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rnf208Q8K0W3 265 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Arl6ip5Q8R5J9 188 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pycr1Q922W5 309 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nudt21Q9CQF3 227 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mtfp1Q9CRB8 166 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ca13Q9D6N1 262 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cmpk1Q9DBP5 196 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dapp1Q9QXT1 280 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r107E9PZJ7 861 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Wdfy1E9Q4P1 410 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ppt1O88531 306 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fgf3P05524 245 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Itga5P11688 1053 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc45a2P58355 530 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Eif5aP63242 154 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cobll1Q3UMF0 1273 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Atg4dQ8BGV9 474 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mblac2Q8BL86 279 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cldn17Q8BXA6 224 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r23Q8R2D0 302 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1094Q8VF13 330 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1347Q8VF33 319 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Serpinb1bQ8VHP7 382 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mrpl18Q9CQL5 180 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc35a4Q9D321 324 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TsaccQ9DA44 124 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r53Q9EP93 310 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rp2Q9EPK2 347 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nkx2-4Q9EQM3 354 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Clcf1Q9QZM3 225 aa8.95□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp811A0A0J9YU71 552 aa8.94□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Akirin2B1AXD8 201 aa8.94□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lrp3E9Q1T6 790 aa8.94□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc16a5G5E8K6 468 aa8.94□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prss39O70169 367 aa8.94□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Irf1P15314 329 aa8.94□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 KitlgP20826 273 aa8.94□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ccr4P51680 360 aa8.94□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lrrc52Q5M8M9 314 aa8.94□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Runx3Q64131 409 aa8.94□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 BckdhbQ6P3A8 390 aa8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24 ms