RNA–Protein interactions for RNA: tW(UCA)Q

tW(UCA)Q, Transcript of Mitochondrial tRNA, annotated as tryptophanyl tRNA (tRNA-Trp), yeastyeast

Gene tW(UCA)Q, Length 74 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(UCA)QtW(UCA)Q RSP5P39940 809 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
tW(UCA)QtW(UCA)Q GAT1P43574 510 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR149CQ99296 730 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPA135P22138 1203 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
tW(UCA)QtW(UCA)Q NET1P47035 1189 aa2.98□□□□□ -1.93
tW(UCA)QtW(UCA)Q RTA1P53047 317 aa2.98□□□□□ -1.93
tW(UCA)QtW(UCA)Q USV1Q12132 391 aa2.98□□□□□ -1.93
tW(UCA)QtW(UCA)Q RNR1P21524 888 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
tW(UCA)QtW(UCA)Q ERG6P25087 383 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
tW(UCA)QtW(UCA)Q SAT4P25333 603 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
tW(UCA)QtW(UCA)Q UGP1P32861 499 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
tW(UCA)QtW(UCA)Q STO1P34160 861 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
tW(UCA)QtW(UCA)Q MCD4P36051 919 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(UCA)QtW(UCA)Q YKR018CP36114 725 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(UCA)QtW(UCA)Q BIT2P38346 545 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(UCA)QtW(UCA)Q GET2P40056 285 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(UCA)QtW(UCA)Q CAF16P43569 289 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(UCA)QtW(UCA)Q NPY1P53164 384 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(UCA)QtW(UCA)Q SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
tW(UCA)QtW(UCA)Q ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q SET3P36124 751 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q YMC2P38087 329 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q GDH3P39708 457 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q PIG2P40187 538 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q NOP9P47077 666 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q HUL5P53119 910 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q YGR151CP53287 111 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q THI22Q06490 572 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q SEC6P32844 805 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q HSL7P38274 827 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q PCL10P53124 433 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q SPC98P53540 846 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q RGT2Q12300 763 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q ERG11P10614 530 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data2.94□□□□□ -1.94not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q BCS1P32839 456 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q APL3P38065 1025 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q RSC8P43609 557 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPN7Q06103 429 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q YDL086WQ07505 273 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q CHS5Q12114 671 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q CIT2P08679 460 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q RAD18P10862 487 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q APN1P22936 367 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q GSY1P23337 708 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q NTH1P32356 751 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q CTP1P38152 299 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q KSP1P38691 1029 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q CCT5P40413 562 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q XBP1P40489 647 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q STB2P46679 850 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q ATG36P46983 293 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q SCS3P53012 380 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q MPS1P54199 764 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q FMP30Q02883 468 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q NHX1Q04121 633 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q COG8Q04632 607 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q ULA1Q12059 462 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q MDM12Q92328 271 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q PHO5P00635 467 aa2.92□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q MIT1P40002 666 aa2.92□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q SET2P46995 733 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q HFD1Q04458 532 aa2.92□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q Q0142Q9ZZW4 58 aa2.92□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q STE12P13574 688 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q YMC1P32331 307 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q HOG1P32485 435 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q YKR051WP36142 418 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q APN2P38207 520 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q KHA1P40309 873 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q ULP2P40537 1034 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q MPS3P47069 682 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q ASN1P49089 572 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q MAL11P53048 616 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q COX18P53239 316 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q NOP7P53261 605 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q NGL2Q03264 515 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q IRC3Q06683 689 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q RKI1Q12189 258 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q MDM20Q12387 796 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
tW(UCA)QtW(UCA)Q TPK2P06245 380 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(UCA)QtW(UCA)Q NUP1P20676 1076 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(UCA)QtW(UCA)Q MBR1P23493 339 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(UCA)QtW(UCA)Q FEN2P25621 512 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
tW(UCA)QtW(UCA)Q YEL1P34225 687 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(UCA)QtW(UCA)Q PMT6P42934 759 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(UCA)QtW(UCA)Q NSE3Q05541 303 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(UCA)QtW(UCA)Q CDC53Q12018 815 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
tW(UCA)QtW(UCA)Q POM34Q12445 299 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(UCA)QtW(UCA)Q ECM3Q99252 613 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(UCA)QtW(UCA)Q CDC9P04819 755 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(UCA)QtW(UCA)Q ERG20P08524 352 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
tW(UCA)QtW(UCA)Q MIH1P23748 554 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(UCA)QtW(UCA)Q VBA3P25594 458 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(UCA)QtW(UCA)Q HOT13P36078 116 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(UCA)QtW(UCA)Q YHR097CP38809 366 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 43.3 ms