RNA–Protein interactions for RNA: YMR094W

CTF13, Transcript of Subunit of the CBF3 complex, yeast

Gene CTF13, Length 1,437 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CTF13	YMR094W	MIH1	P23748	554 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	VBA3	P25594	458 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	HSL7	P38274	827 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	YKR018C	P36114	725 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
CTF13	YMR094W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	HOF1	Q05080	669 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	USV1	Q12132	391 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	PEX1	P24004	1043 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	MEF1	P25039	761 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	HOG1	P32485	435 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	PCL10	P53124	433 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	COX18	P53239	316 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	SRD1	P09007	221 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	GID8	P40208	455 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	NUP82	P40368	713 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	BUD6	P41697	788 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	FUB1	P25659	250 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	ARP4	P80428	489 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	AFT2	Q08957	416 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	ECM3	Q99252	613 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	CIT2	P08679	460 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	SET3	P36124	751 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	RAD18	P10862	487 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	PHO8	P11491	566 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	GMH1	P36125	273 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	PAC2	P39937	518 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	YNL195C	P40168	261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	MSH2	P25847	964 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	BCS1	P32839	456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	PEX6	P33760	1030 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	PIG2	P40187	538 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	THI22	Q06490	572 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	PRP28	P23394	588 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	MNN4	P36044	1178 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	APN2	P38207	520 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	BIT2	P38346	545 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	MUP3	P38734	546 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	OCA5	P38738	679 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	YGR151C	P53287	111 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	UGO1	Q03327	502 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	ABF1	P14164	731 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	VPS34	P22543	875 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	KCC4	P25389	1037 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	THI4	P32318	326 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	ORC2	P32833	620 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	MRK1	P50873	501 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	SPC98	P53540	846 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	AIM14	P53109	570 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	ATG33	Q06485	197 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CTF13	YMR094W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	PCL2	P25693	308 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	COG8	Q04632	607 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	SEC6	P32844	805 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	GIN4	Q12263	1142 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	ICT1	Q12385	394 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	HMG1	P12683	1054 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	YEL1	P34225	687 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	YMC2	P38087	329 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	MPS3	P47069	682 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	NMA2	P53204	395 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	OSW1	Q08692	278 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	STE12	P13574	688 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	SFL1	P20134	766 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	YHR202W	P38887	602 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	YIL077C	P40508	320 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	RFX1	P48743	811 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	YAP7	Q08182	245 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	CTP1	P38152	299 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	KHA1	P40309	873 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	DCS2	Q12123	353 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	POM34	Q12445	299 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CTF13	YMR094W	LAM4	P38800	1345 aa		4.48	□□□□□ -1.69

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